Protein–RNA interactions for Protein: Q13133

NR1H3, Oxysterols receptor LXR-alpha, humanhuman

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Length 447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR1H3Q13133 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NR1H3Q13133 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NR1H3Q13133 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NR1H3Q13133 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NR1H3Q13133 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NR1H3Q13133 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NR1H3Q13133 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NR1H3Q13133 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NR1H3Q13133 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NR1H3Q13133 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NR1H3Q13133 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NR1H3Q13133 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NR1H3Q13133 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NR1H3Q13133 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NR1H3Q13133 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NR1H3Q13133 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NR1H3Q13133 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NR1H3Q13133 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NR1H3Q13133 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NR1H3Q13133 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NR1H3Q13133 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NR1H3Q13133 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NR1H3Q13133 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NR1H3Q13133 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NR1H3Q13133 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NR1H3Q13133 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NR1H3Q13133 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NR1H3Q13133 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NR1H3Q13133 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
NR1H3Q13133 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NR1H3Q13133 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NR1H3Q13133 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
NR1H3Q13133 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NR1H3Q13133 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NR1H3Q13133 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NR1H3Q13133 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NR1H3Q13133 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NR1H3Q13133 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NR1H3Q13133 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NR1H3Q13133 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NR1H3Q13133 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NR1H3Q13133 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NR1H3Q13133 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NR1H3Q13133 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NR1H3Q13133 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NR1H3Q13133 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NR1H3Q13133 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NR1H3Q13133 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NR1H3Q13133 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NR1H3Q13133 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NR1H3Q13133 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NR1H3Q13133 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
NR1H3Q13133 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NR1H3Q13133 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NR1H3Q13133 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NR1H3Q13133 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
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NR1H3Q13133 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
NR1H3Q13133 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
NR1H3Q13133 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
NR1H3Q13133 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
NR1H3Q13133 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
NR1H3Q13133 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NR1H3Q13133 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NR1H3Q13133 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NR1H3Q13133 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NR1H3Q13133 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NR1H3Q13133 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NR1H3Q13133 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NR1H3Q13133 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NR1H3Q13133 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NR1H3Q13133 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NR1H3Q13133 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NR1H3Q13133 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NR1H3Q13133 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NR1H3Q13133 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NR1H3Q13133 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NR1H3Q13133 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NR1H3Q13133 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NR1H3Q13133 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NR1H3Q13133 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NR1H3Q13133 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NR1H3Q13133 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NR1H3Q13133 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NR1H3Q13133 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NR1H3Q13133 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NR1H3Q13133 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NR1H3Q13133 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NR1H3Q13133 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NR1H3Q13133 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NR1H3Q13133 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NR1H3Q13133 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NR1H3Q13133 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NR1H3Q13133 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NR1H3Q13133 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NR1H3Q13133 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NR1H3Q13133 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NR1H3Q13133 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NR1H3Q13133 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NR1H3Q13133 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
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