Protein–RNA interactions for Protein: Q12988

HSPB3, Heat shock protein beta-3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSPB3Q12988 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
HSPB3Q12988 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
HSPB3Q12988 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
HSPB3Q12988 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
HSPB3Q12988 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
HSPB3Q12988 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
HSPB3Q12988 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
HSPB3Q12988 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
HSPB3Q12988 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
HSPB3Q12988 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
HSPB3Q12988 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
HSPB3Q12988 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
HSPB3Q12988 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
HSPB3Q12988 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
HSPB3Q12988 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
HSPB3Q12988 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
HSPB3Q12988 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
HSPB3Q12988 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
HSPB3Q12988 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
HSPB3Q12988 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
HSPB3Q12988 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
HSPB3Q12988 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC19.18■□□□□ 0.66
HSPB3Q12988 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
HSPB3Q12988 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
HSPB3Q12988 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
HSPB3Q12988 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
HSPB3Q12988 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
HSPB3Q12988 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
HSPB3Q12988 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
HSPB3Q12988 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
HSPB3Q12988 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
HSPB3Q12988 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
HSPB3Q12988 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
HSPB3Q12988 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
HSPB3Q12988 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
HSPB3Q12988 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
HSPB3Q12988 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
HSPB3Q12988 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
HSPB3Q12988 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
HSPB3Q12988 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
HSPB3Q12988 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
HSPB3Q12988 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
HSPB3Q12988 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
HSPB3Q12988 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
HSPB3Q12988 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
HSPB3Q12988 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC19.17■□□□□ 0.66
HSPB3Q12988 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
HSPB3Q12988 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
HSPB3Q12988 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
HSPB3Q12988 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
HSPB3Q12988 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
HSPB3Q12988 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
HSPB3Q12988 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
HSPB3Q12988 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
HSPB3Q12988 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
HSPB3Q12988 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
HSPB3Q12988 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
HSPB3Q12988 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
HSPB3Q12988 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
HSPB3Q12988 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
HSPB3Q12988 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
HSPB3Q12988 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
HSPB3Q12988 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
HSPB3Q12988 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
HSPB3Q12988 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
HSPB3Q12988 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
HSPB3Q12988 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
HSPB3Q12988 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.16■□□□□ 0.66
HSPB3Q12988 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
HSPB3Q12988 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
HSPB3Q12988 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
HSPB3Q12988 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
HSPB3Q12988 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
HSPB3Q12988 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
HSPB3Q12988 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
HSPB3Q12988 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
HSPB3Q12988 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
HSPB3Q12988 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
HSPB3Q12988 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
HSPB3Q12988 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
HSPB3Q12988 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
HSPB3Q12988 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
HSPB3Q12988 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
HSPB3Q12988 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC19.15■□□□□ 0.66
HSPB3Q12988 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
HSPB3Q12988 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
HSPB3Q12988 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
HSPB3Q12988 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
HSPB3Q12988 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
HSPB3Q12988 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
HSPB3Q12988 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
HSPB3Q12988 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
HSPB3Q12988 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
HSPB3Q12988 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
HSPB3Q12988 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
HSPB3Q12988 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
HSPB3Q12988 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
HSPB3Q12988 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
HSPB3Q12988 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
HSPB3Q12988 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
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