Protein–RNA interactions for Protein: Q12948

FOXC1, Forkhead box protein C1, humanhuman

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Length 553 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXC1Q12948 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
FOXC1Q12948 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
FOXC1Q12948 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
FOXC1Q12948 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
FOXC1Q12948 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
FOXC1Q12948 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
FOXC1Q12948 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
FOXC1Q12948 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
FOXC1Q12948 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
FOXC1Q12948 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
FOXC1Q12948 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
FOXC1Q12948 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
FOXC1Q12948 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
FOXC1Q12948 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
FOXC1Q12948 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
FOXC1Q12948 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
FOXC1Q12948 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
FOXC1Q12948 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
FOXC1Q12948 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
FOXC1Q12948 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
FOXC1Q12948 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
FOXC1Q12948 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
FOXC1Q12948 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
FOXC1Q12948 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
FOXC1Q12948 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
FOXC1Q12948 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
FOXC1Q12948 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
FOXC1Q12948 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
FOXC1Q12948 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
FOXC1Q12948 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
FOXC1Q12948 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
FOXC1Q12948 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
FOXC1Q12948 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
FOXC1Q12948 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
FOXC1Q12948 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
FOXC1Q12948 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
FOXC1Q12948 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
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FOXC1Q12948 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
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FOXC1Q12948 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
FOXC1Q12948 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
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FOXC1Q12948 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
FOXC1Q12948 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
FOXC1Q12948 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
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FOXC1Q12948 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
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FOXC1Q12948 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
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FOXC1Q12948 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
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FOXC1Q12948 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
FOXC1Q12948 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
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FOXC1Q12948 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
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FOXC1Q12948 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
FOXC1Q12948 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
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FOXC1Q12948 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
FOXC1Q12948 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
FOXC1Q12948 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
FOXC1Q12948 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
FOXC1Q12948 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
FOXC1Q12948 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
FOXC1Q12948 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
FOXC1Q12948 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
FOXC1Q12948 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
FOXC1Q12948 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
FOXC1Q12948 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
FOXC1Q12948 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
FOXC1Q12948 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
FOXC1Q12948 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
FOXC1Q12948 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
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