Protein–RNA interactions for Protein: Q12923

PTPN13, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 13, humanhuman

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Length 2,485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN13Q12923 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
PTPN13Q12923 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PTPN13Q12923 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PTPN13Q12923 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PTPN13Q12923 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PTPN13Q12923 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
PTPN13Q12923 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
PTPN13Q12923 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PTPN13Q12923 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PTPN13Q12923 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PTPN13Q12923 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PTPN13Q12923 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PTPN13Q12923 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PTPN13Q12923 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PTPN13Q12923 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PTPN13Q12923 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
PTPN13Q12923 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PTPN13Q12923 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PTPN13Q12923 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PTPN13Q12923 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
PTPN13Q12923 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
PTPN13Q12923 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PTPN13Q12923 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PTPN13Q12923 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PTPN13Q12923 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PTPN13Q12923 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PTPN13Q12923 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
PTPN13Q12923 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PTPN13Q12923 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PTPN13Q12923 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PTPN13Q12923 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PTPN13Q12923 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PTPN13Q12923 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PTPN13Q12923 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PTPN13Q12923 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PTPN13Q12923 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PTPN13Q12923 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
PTPN13Q12923 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PTPN13Q12923 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PTPN13Q12923 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PTPN13Q12923 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PTPN13Q12923 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PTPN13Q12923 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PTPN13Q12923 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PTPN13Q12923 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PTPN13Q12923 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PTPN13Q12923 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PTPN13Q12923 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PTPN13Q12923 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PTPN13Q12923 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PTPN13Q12923 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PTPN13Q12923 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
PTPN13Q12923 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PTPN13Q12923 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
PTPN13Q12923 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
PTPN13Q12923 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PTPN13Q12923 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PTPN13Q12923 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PTPN13Q12923 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
PTPN13Q12923 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PTPN13Q12923 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PTPN13Q12923 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PTPN13Q12923 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PTPN13Q12923 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PTPN13Q12923 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PTPN13Q12923 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PTPN13Q12923 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PTPN13Q12923 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTPN13Q12923 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTPN13Q12923 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTPN13Q12923 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTPN13Q12923 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTPN13Q12923 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
PTPN13Q12923 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTPN13Q12923 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTPN13Q12923 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTPN13Q12923 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTPN13Q12923 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTPN13Q12923 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTPN13Q12923 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTPN13Q12923 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTPN13Q12923 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTPN13Q12923 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
PTPN13Q12923 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
PTPN13Q12923 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTPN13Q12923 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTPN13Q12923 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTPN13Q12923 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
PTPN13Q12923 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTPN13Q12923 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTPN13Q12923 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTPN13Q12923 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTPN13Q12923 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTPN13Q12923 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
PTPN13Q12923 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
PTPN13Q12923 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PTPN13Q12923 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PTPN13Q12923 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PTPN13Q12923 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PTPN13Q12923 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
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