Protein–RNA interactions for Protein: Q12860

CNTN1, Contactin-1, humanhuman

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Length 1,018 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN1Q12860 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CNTN1Q12860 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CNTN1Q12860 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CNTN1Q12860 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CNTN1Q12860 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CNTN1Q12860 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CNTN1Q12860 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CNTN1Q12860 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CNTN1Q12860 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CNTN1Q12860 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CNTN1Q12860 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CNTN1Q12860 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CNTN1Q12860 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CNTN1Q12860 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CNTN1Q12860 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
CNTN1Q12860 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CNTN1Q12860 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CNTN1Q12860 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CNTN1Q12860 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CNTN1Q12860 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CNTN1Q12860 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CNTN1Q12860 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CNTN1Q12860 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CNTN1Q12860 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CNTN1Q12860 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CNTN1Q12860 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
CNTN1Q12860 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CNTN1Q12860 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CNTN1Q12860 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CNTN1Q12860 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CNTN1Q12860 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
CNTN1Q12860 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CNTN1Q12860 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CNTN1Q12860 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CNTN1Q12860 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CNTN1Q12860 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CNTN1Q12860 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CNTN1Q12860 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CNTN1Q12860 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CNTN1Q12860 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CNTN1Q12860 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CNTN1Q12860 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CNTN1Q12860 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CNTN1Q12860 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CNTN1Q12860 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CNTN1Q12860 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CNTN1Q12860 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CNTN1Q12860 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CNTN1Q12860 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
CNTN1Q12860 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CNTN1Q12860 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CNTN1Q12860 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CNTN1Q12860 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CNTN1Q12860 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
CNTN1Q12860 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CNTN1Q12860 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CNTN1Q12860 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CNTN1Q12860 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CNTN1Q12860 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CNTN1Q12860 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CNTN1Q12860 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CNTN1Q12860 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CNTN1Q12860 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CNTN1Q12860 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CNTN1Q12860 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CNTN1Q12860 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
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CNTN1Q12860 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
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CNTN1Q12860 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CNTN1Q12860 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CNTN1Q12860 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CNTN1Q12860 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CNTN1Q12860 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CNTN1Q12860 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CNTN1Q12860 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CNTN1Q12860 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CNTN1Q12860 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
CNTN1Q12860 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CNTN1Q12860 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CNTN1Q12860 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CNTN1Q12860 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CNTN1Q12860 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CNTN1Q12860 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CNTN1Q12860 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CNTN1Q12860 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CNTN1Q12860 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CNTN1Q12860 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CNTN1Q12860 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CNTN1Q12860 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CNTN1Q12860 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CNTN1Q12860 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CNTN1Q12860 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CNTN1Q12860 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CNTN1Q12860 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
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