Protein–RNA interactions for Protein: Q12791

KCNMA1, Calcium-activated potassium channel subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,236 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNMA1Q12791 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
KCNMA1Q12791 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
KCNMA1Q12791 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
KCNMA1Q12791 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
KCNMA1Q12791 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KCNMA1Q12791 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
KCNMA1Q12791 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
KCNMA1Q12791 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KCNMA1Q12791 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KCNMA1Q12791 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
KCNMA1Q12791 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
KCNMA1Q12791 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KCNMA1Q12791 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KCNMA1Q12791 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KCNMA1Q12791 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
KCNMA1Q12791 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
KCNMA1Q12791 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KCNMA1Q12791 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
KCNMA1Q12791 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KCNMA1Q12791 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KCNMA1Q12791 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
KCNMA1Q12791 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
KCNMA1Q12791 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
KCNMA1Q12791 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
KCNMA1Q12791 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
KCNMA1Q12791 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
KCNMA1Q12791 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
KCNMA1Q12791 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
KCNMA1Q12791 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
KCNMA1Q12791 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KCNMA1Q12791 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
KCNMA1Q12791 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
KCNMA1Q12791 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
KCNMA1Q12791 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
KCNMA1Q12791 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
KCNMA1Q12791 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
KCNMA1Q12791 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
KCNMA1Q12791 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
KCNMA1Q12791 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
KCNMA1Q12791 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
KCNMA1Q12791 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
KCNMA1Q12791 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
KCNMA1Q12791 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
KCNMA1Q12791 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
KCNMA1Q12791 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
KCNMA1Q12791 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
KCNMA1Q12791 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
KCNMA1Q12791 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
KCNMA1Q12791 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
KCNMA1Q12791 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
KCNMA1Q12791 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
KCNMA1Q12791 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
KCNMA1Q12791 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
KCNMA1Q12791 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
KCNMA1Q12791 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
KCNMA1Q12791 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
KCNMA1Q12791 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
KCNMA1Q12791 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
KCNMA1Q12791 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
KCNMA1Q12791 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
KCNMA1Q12791 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
KCNMA1Q12791 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
KCNMA1Q12791 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
KCNMA1Q12791 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
KCNMA1Q12791 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
KCNMA1Q12791 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
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KCNMA1Q12791 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
KCNMA1Q12791 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
KCNMA1Q12791 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
KCNMA1Q12791 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
KCNMA1Q12791 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC21.95■■□□□ 1.1
KCNMA1Q12791 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
KCNMA1Q12791 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
KCNMA1Q12791 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
KCNMA1Q12791 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
KCNMA1Q12791 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
KCNMA1Q12791 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
KCNMA1Q12791 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
KCNMA1Q12791 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
KCNMA1Q12791 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
KCNMA1Q12791 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
KCNMA1Q12791 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
KCNMA1Q12791 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
KCNMA1Q12791 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
KCNMA1Q12791 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
KCNMA1Q12791 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
KCNMA1Q12791 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
KCNMA1Q12791 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
KCNMA1Q12791 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
KCNMA1Q12791 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
KCNMA1Q12791 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
KCNMA1Q12791 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
KCNMA1Q12791 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
KCNMA1Q12791 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
KCNMA1Q12791 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
KCNMA1Q12791 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
KCNMA1Q12791 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
KCNMA1Q12791 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
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