Protein–RNA interactions for Protein: Q12493

NKP1, Inner kinetochore subunit NKP1, yeastyeast

Predictions only

Length 238 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
NKP1Q12493 NOP14YDL148C 2433 nt2.39□□□□□ -2.03
NKP1Q12493 IRC10YOL015W 1761 nt2.38□□□□□ -2.03
NKP1Q12493 PET309YLR067C 2898 nt2.38□□□□□ -2.03
NKP1Q12493 YDL041WYDL041W 354 nt2.38□□□□□ -2.03
NKP1Q12493 SDH7YDR511W 402 nt2.38□□□□□ -2.03
NKP1Q12493 SEC22YLR268W 645 nt2.38□□□□□ -2.03
NKP1Q12493 SEC16YPL085W 6588 nt2.38□□□□□ -2.03
NKP1Q12493 COX1Q0045 1605 nt2.38□□□□□ -2.03
NKP1Q12493 CDC27YBL084C 2277 nt2.38□□□□□ -2.03
NKP1Q12493 NAM7YMR080C 2916 nt2.38□□□□□ -2.03
NKP1Q12493 ATG9YDL149W 2994 nt2.37□□□□□ -2.03
NKP1Q12493 CBS1YDL069C 690 nt2.37□□□□□ -2.03
NKP1Q12493 ATG31YDR022C 591 nt2.37□□□□□ -2.03
NKP1Q12493 YAL068W-AYAL068W-A 255 nt2.37□□□□□ -2.03
NKP1Q12493 YAR047CYAR047C 321 nt2.37□□□□□ -2.03
NKP1Q12493 PDR8YLR266C 2106 nt2.37□□□□□ -2.03
NKP1Q12493 YLR434CYLR434C 384 nt2.37□□□□□ -2.03
NKP1Q12493 ERP4YOR016C 624 nt2.37□□□□□ -2.03
NKP1Q12493 IRC8YJL051W 2469 nt2.37□□□□□ -2.03
NKP1Q12493 UBP1YDL122W 2430 nt2.37□□□□□ -2.03
NKP1Q12493 YDL062WYDL062W 426 nt2.36□□□□□ -2.03
NKP1Q12493 snR79snR79 84 nt2.36□□□□□ -2.03
NKP1Q12493 LSO2YGR169C-A 279 nt2.36□□□□□ -2.03
NKP1Q12493 YLR287CYLR287C 1068 nt2.36□□□□□ -2.03
NKP1Q12493 MKT1YNL085W 2493 nt2.35□□□□□ -2.03
NKP1Q12493 YHR078WYHR078W 1659 nt2.35□□□□□ -2.03
NKP1Q12493 YDR524W-CYDR524W-C 90 nt2.35□□□□□ -2.03
NKP1Q12493 YGL069CYGL069C 465 nt2.35□□□□□ -2.03
NKP1Q12493 GPX2YBR244W 489 nt2.35□□□□□ -2.03
NKP1Q12493 VMR1YHL035C 4779 nt2.35□□□□□ -2.03
NKP1Q12493 YSW1YBR148W 1830 nt2.35□□□□□ -2.03
NKP1Q12493 STB4YMR019W 2850 nt2.35□□□□□ -2.03
NKP1Q12493 SPP41YDR464W 4308 nt2.34□□□□□ -2.03
NKP1Q12493 PDR1YGL013C 3207 nt2.34□□□□□ -2.03
NKP1Q12493 YDR250CYDR250C 276 nt2.34□□□□□ -2.03
NKP1Q12493 YHL009W-AYHL009W-A 1242 nt2.34□□□□□ -2.03
NKP1Q12493 YAL059C-AYAL059C-A 423 nt2.34□□□□□ -2.03
NKP1Q12493 KAR3YPR141C 2190 nt2.34□□□□□ -2.04
NKP1Q12493 CHC1YGL206C 4962 nt2.34□□□□□ -2.04
NKP1Q12493 MGA2YIR033W 3342 nt2.34□□□□□ -2.04
NKP1Q12493 SGD1YLR336C 2700 nt2.33□□□□□ -2.04
NKP1Q12493 DAS1YJL149W 1992 nt2.33□□□□□ -2.04
NKP1Q12493 YCR087C-AYCR087C-A 462 nt2.33□□□□□ -2.04
NKP1Q12493 URM1YIL008W 300 nt2.33□□□□□ -2.04
NKP1Q12493 RPS24BYIL069C 408 nt2.33□□□□□ -2.04
NKP1Q12493 RPH1YER169W 2391 nt2.33□□□□□ -2.04
NKP1Q12493 HSK3YKL138C-A 210 nt2.32□□□□□ -2.04
NKP1Q12493 YBR012CYBR012C 420 nt2.32□□□□□ -2.04
NKP1Q12493 SWT1YOR166C 1377 nt2.32□□□□□ -2.04
NKP1Q12493 SET2YJL168C 2202 nt2.32□□□□□ -2.04
NKP1Q12493 YER023C-AYER023C-A 213 nt2.31□□□□□ -2.04
NKP1Q12493 BSC3YLR465C 309 nt2.31□□□□□ -2.04
NKP1Q12493 YOR029WYOR029W 336 nt2.31□□□□□ -2.04
NKP1Q12493 YOR394C-AYOR394C-A 168 nt2.31□□□□□ -2.04
NKP1Q12493 YPR146CYPR146C 330 nt2.31□□□□□ -2.04
NKP1Q12493 DIE2YGR227W 1578 nt2.31□□□□□ -2.04
NKP1Q12493 HCS1YKL017C 2052 nt2.3□□□□□ -2.04
NKP1Q12493 MSS11YMR164C 2277 nt2.3□□□□□ -2.04
NKP1Q12493 MNL2YLR057W 2550 nt2.3□□□□□ -2.04
NKP1Q12493 YER137W-AYER137W-A 306 nt2.3□□□□□ -2.04
NKP1Q12493 BRP1YGL007W 378 nt2.3□□□□□ -2.04
NKP1Q12493 YHL046W-AYHL046W-A 327 nt2.3□□□□□ -2.04
NKP1Q12493 CYB5YNL111C 363 nt2.3□□□□□ -2.04
NKP1Q12493 MRPL50YNR022C 420 nt2.3□□□□□ -2.04
NKP1Q12493 KOG1YHR186C 4674 nt2.3□□□□□ -2.04
NKP1Q12493 ELG1YOR144C 2376 nt2.3□□□□□ -2.04
NKP1Q12493 CDC24YAL041W 2565 nt2.3□□□□□ -2.04
NKP1Q12493 NUP120YKL057C 3114 nt2.3□□□□□ -2.04
NKP1Q12493 CFT2YLR115W 2580 nt2.29□□□□□ -2.04
NKP1Q12493 SCH9YHR205W 2475 nt2.29□□□□□ -2.04
NKP1Q12493 NOT5YPR072W 1683 nt2.29□□□□□ -2.04
NKP1Q12493 YER076W-AYER076W-A 348 nt2.29□□□□□ -2.04
NKP1Q12493 HIT1YJR055W 495 nt2.29□□□□□ -2.04
NKP1Q12493 YPL185WYPL185W 396 nt2.29□□□□□ -2.04
NKP1Q12493 SSD1YDR293C 3753 nt2.29□□□□□ -2.04
NKP1Q12493 DBP10YDL031W 2988 nt2.29□□□□□ -2.04
NKP1Q12493 YLR149CYLR149C 2193 nt2.29□□□□□ -2.04
NKP1Q12493 VTC3YPL019C 2508 nt2.28□□□□□ -2.04
NKP1Q12493 YBR121C-AYBR121C-A 159 nt2.28□□□□□ -2.04
NKP1Q12493 PAU10YDR542W 363 nt2.27□□□□□ -2.05
NKP1Q12493 PAU11YGL261C 363 nt2.27□□□□□ -2.05
NKP1Q12493 YIL156W-BYIL156W-B 222 nt2.27□□□□□ -2.05
NKP1Q12493 TMA7YLR262C-A 195 nt2.27□□□□□ -2.05
NKP1Q12493 PAU4YLR461W 363 nt2.27□□□□□ -2.05
NKP1Q12493 YBL071CYBL071C 309 nt2.27□□□□□ -2.05
NKP1Q12493 PGA1YNL158W 597 nt2.27□□□□□ -2.05
NKP1Q12493 YMR045CYMR045C 5268 nt2.27□□□□□ -2.05
NKP1Q12493 YCR102W-AYCR102W-A 198 nt2.26□□□□□ -2.05
NKP1Q12493 RTT102YGR275W 474 nt2.26□□□□□ -2.05
NKP1Q12493 TMA22YJR014W 597 nt2.26□□□□□ -2.05
NKP1Q12493 RPS18BYML026C 441 nt2.26□□□□□ -2.05
NKP1Q12493 ARP7YPR034W 1434 nt2.25□□□□□ -2.05
NKP1Q12493 PLC1YPL268W 2610 nt2.25□□□□□ -2.05
NKP1Q12493 tF(GAA)DtF(GAA)D 73 nt2.25□□□□□ -2.05
NKP1Q12493 tF(GAA)NtF(GAA)N 73 nt2.25□□□□□ -2.05
NKP1Q12493 YER121WYER121W 345 nt2.25□□□□□ -2.05
NKP1Q12493 RPA34YJL148W 702 nt2.25□□□□□ -2.05
NKP1Q12493 UBP2YOR124C 3819 nt2.25□□□□□ -2.05
NKP1Q12493 RPS12YOR369C 432 nt2.25□□□□□ -2.05
NKP1Q12493 YBR224WYBR224W 516 nt2.25□□□□□ -2.05
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 17.5 ms