Protein–RNA interactions for Protein: Q12483

SNF8, Vacuolar-sorting protein SNF8, yeastyeast

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Length 233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SNF8Q12483 DAS1YJL149W 1992 nt1.43□□□□□ -2.18
SNF8Q12483 YDL068WYDL068W 330 nt1.42□□□□□ -2.18
SNF8Q12483 YIL102CYIL102C 306 nt1.42□□□□□ -2.18
SNF8Q12483 PFD1YJL179W 330 nt1.42□□□□□ -2.18
SNF8Q12483 YBR174CYBR174C 315 nt1.42□□□□□ -2.18
SNF8Q12483 BRR2YER172C 6492 nt1.42□□□□□ -2.18
SNF8Q12483 SSK2YNR031C 4740 nt1.42□□□□□ -2.18
SNF8Q12483 YSW1YBR148W 1830 nt1.42□□□□□ -2.18
SNF8Q12483 ASM4YDL088C 1587 nt1.42□□□□□ -2.18
SNF8Q12483 MNL2YLR057W 2550 nt1.42□□□□□ -2.18
SNF8Q12483 CTF4YPR135W 2784 nt1.42□□□□□ -2.18
SNF8Q12483 MDM32YOR147W 1869 nt1.41□□□□□ -2.18
SNF8Q12483 IRA1YBR140C 9279 nt1.41□□□□□ -2.18
SNF8Q12483 MDM20YOL076W 2391 nt1.41□□□□□ -2.18
SNF8Q12483 IRE1YHR079C 3348 nt1.41□□□□□ -2.18
SNF8Q12483 MEC1YBR136W 7107 nt1.41□□□□□ -2.18
SNF8Q12483 YDR220CYDR220C 294 nt1.41□□□□□ -2.18
SNF8Q12483 YJR087WYJR087W 351 nt1.41□□□□□ -2.18
SNF8Q12483 CMS1YLR003C 876 nt1.41□□□□□ -2.18
SNF8Q12483 SEC22YLR268W 645 nt1.41□□□□□ -2.18
SNF8Q12483 YBL083CYBL083C 426 nt1.41□□□□□ -2.18
SNF8Q12483 GPX2YBR244W 489 nt1.41□□□□□ -2.18
SNF8Q12483 CHS1YNL192W 3396 nt1.41□□□□□ -2.18
SNF8Q12483 CCH1YGR217W 6120 nt1.4□□□□□ -2.19
SNF8Q12483 YFR009W-AYFR009W-A 258 nt1.4□□□□□ -2.19
SNF8Q12483 tQ(UUG)E2tQ(UUG)E2 72 nt1.4□□□□□ -2.19
SNF8Q12483 YBR224WYBR224W 516 nt1.4□□□□□ -2.19
SNF8Q12483 SXM1YDR395W 2835 nt1.4□□□□□ -2.19
SNF8Q12483 FRK1YPL141C 2598 nt1.4□□□□□ -2.19
SNF8Q12483 YDR461C-AYDR461C-A 243 nt1.39□□□□□ -2.19
SNF8Q12483 YGL015CYGL015C 393 nt1.39□□□□□ -2.19
SNF8Q12483 LRP1YHR081W 555 nt1.39□□□□□ -2.19
SNF8Q12483 MCM22YJR135C 720 nt1.39□□□□□ -2.19
SNF8Q12483 TIF11YMR260C 462 nt1.39□□□□□ -2.19
SNF8Q12483 YPR177CYPR177C 372 nt1.39□□□□□ -2.19
SNF8Q12483 YGR250CYGR250C 2346 nt1.39□□□□□ -2.19
SNF8Q12483 HMI1YOL095C 2121 nt1.39□□□□□ -2.19
SNF8Q12483 KAR3YPR141C 2190 nt1.38□□□□□ -2.19
SNF8Q12483 PMD1YER132C 5262 nt1.38□□□□□ -2.19
SNF8Q12483 SCEIQ0160 708 nt1.38□□□□□ -2.19
SNF8Q12483 YHR214W-AYHR214W-A 486 nt1.38□□□□□ -2.19
SNF8Q12483 YAR068WYAR068W 486 nt1.38□□□□□ -2.19
SNF8Q12483 RPB11YOL005C 363 nt1.38□□□□□ -2.19
SNF8Q12483 YLR149CYLR149C 2193 nt1.38□□□□□ -2.19
SNF8Q12483 GPM2YDL021W 936 nt1.37□□□□□ -2.19
SNF8Q12483 YIR020CYIR020C 303 nt1.37□□□□□ -2.19
SNF8Q12483 YLR271WYLR271W 825 nt1.37□□□□□ -2.19
SNF8Q12483 SEN15YMR059W 387 nt1.37□□□□□ -2.19
SNF8Q12483 COX7YMR256C 183 nt1.37□□□□□ -2.19
SNF8Q12483 YPL197CYPL197C 414 nt1.37□□□□□ -2.19
SNF8Q12483 PIK1YNL267W 3201 nt1.37□□□□□ -2.19
SNF8Q12483 CTR9YOL145C 3234 nt1.37□□□□□ -2.19
SNF8Q12483 AFR1YDR085C 1863 nt1.37□□□□□ -2.19
SNF8Q12483 GNT1YOR320C 1476 nt1.37□□□□□ -2.19
SNF8Q12483 BST1YFL025C 3090 nt1.36□□□□□ -2.19
SNF8Q12483 YCR043CYCR043C 384 nt1.36□□□□□ -2.19
SNF8Q12483 YER088C-AYER088C-A 324 nt1.36□□□□□ -2.19
SNF8Q12483 SLX9YGR081C 633 nt1.36□□□□□ -2.19
SNF8Q12483 TIM10YHR005C-A 282 nt1.36□□□□□ -2.19
SNF8Q12483 PRP21YJL203W 843 nt1.36□□□□□ -2.19
SNF8Q12483 YJR140W-AYJR140W-A 150 nt1.36□□□□□ -2.19
SNF8Q12483 YOL029CYOL029C 606 nt1.36□□□□□ -2.19
SNF8Q12483 MEI5YPL121C 669 nt1.36□□□□□ -2.19
SNF8Q12483 REF2YDR195W 1602 nt1.36□□□□□ -2.19
SNF8Q12483 SGD1YLR336C 2700 nt1.36□□□□□ -2.19
SNF8Q12483 FIG2YCR089W 4830 nt1.35□□□□□ -2.19
SNF8Q12483 CAT8YMR280C 4302 nt1.35□□□□□ -2.19
SNF8Q12483 IRC19YLL033W 693 nt1.35□□□□□ -2.19
SNF8Q12483 YDL187CYDL187C 330 nt1.34□□□□□ -2.19
SNF8Q12483 YFL012W-AYFL012W-A 375 nt1.34□□□□□ -2.19
SNF8Q12483 YKL111CYKL111C 336 nt1.34□□□□□ -2.19
SNF8Q12483 NBP1YLR457C 960 nt1.34□□□□□ -2.19
SNF8Q12483 CDC31YOR257W 486 nt1.34□□□□□ -2.19
SNF8Q12483 MSC6YOR354C 2079 nt1.34□□□□□ -2.19
SNF8Q12483 UTP13YLR222C 2454 nt1.34□□□□□ -2.2
SNF8Q12483 VPS52YDR484W 1926 nt1.34□□□□□ -2.2
SNF8Q12483 PEP3YLR148W 2757 nt1.34□□□□□ -2.2
SNF8Q12483 PET127YOR017W 2403 nt1.34□□□□□ -2.2
SNF8Q12483 FYV8YGR196C 2454 nt1.33□□□□□ -2.2
SNF8Q12483 YLR140WYLR140W 327 nt1.33□□□□□ -2.2
SNF8Q12483 PET123YOR158W 957 nt1.33□□□□□ -2.2
SNF8Q12483 SNF5YBR289W 2718 nt1.33□□□□□ -2.2
SNF8Q12483 CDC25YLR310C 4770 nt1.33□□□□□ -2.2
SNF8Q12483 SWT1YOR166C 1377 nt1.33□□□□□ -2.2
SNF8Q12483 RLM1YPL089C 2031 nt1.32□□□□□ -2.2
SNF8Q12483 snR79snR79 84 nt1.32□□□□□ -2.2
SNF8Q12483 CHZ1YER030W 462 nt1.32□□□□□ -2.2
SNF8Q12483 IES5YER092W 378 nt1.32□□□□□ -2.2
SNF8Q12483 tT(UGU)Q1tT(UGU)Q1 76 nt1.32□□□□□ -2.2
SNF8Q12483 RCN1YKL159C 636 nt1.32□□□□□ -2.2
SNF8Q12483 YBL029C-AYBL029C-A 285 nt1.32□□□□□ -2.2
SNF8Q12483 SMY1YKL079W 1971 nt1.31□□□□□ -2.2
SNF8Q12483 YDL041WYDL041W 354 nt1.31□□□□□ -2.2
SNF8Q12483 YFL012WYFL012W 447 nt1.31□□□□□ -2.2
SNF8Q12483 SPO13YHR014W 876 nt1.31□□□□□ -2.2
SNF8Q12483 RPC10YHR143W-A 213 nt1.31□□□□□ -2.2
SNF8Q12483 SWS2YNL081C 432 nt1.31□□□□□ -2.2
SNF8Q12483 EGD1YPL037C 474 nt1.31□□□□□ -2.2
SNF8Q12483 NCA2YPR155C 1851 nt1.31□□□□□ -2.2
SNF8Q12483 NUP120YKL057C 3114 nt1.3□□□□□ -2.2
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