Protein–RNA interactions for Protein: Q10570

CPSF1, Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,443 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPSF1Q10570 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CPSF1Q10570 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CPSF1Q10570 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CPSF1Q10570 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CPSF1Q10570 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CPSF1Q10570 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CPSF1Q10570 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CPSF1Q10570 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CPSF1Q10570 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CPSF1Q10570 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CPSF1Q10570 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CPSF1Q10570 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CPSF1Q10570 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CPSF1Q10570 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CPSF1Q10570 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CPSF1Q10570 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CPSF1Q10570 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CPSF1Q10570 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CPSF1Q10570 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CPSF1Q10570 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CPSF1Q10570 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CPSF1Q10570 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
CPSF1Q10570 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CPSF1Q10570 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CPSF1Q10570 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
CPSF1Q10570 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CPSF1Q10570 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CPSF1Q10570 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CPSF1Q10570 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CPSF1Q10570 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CPSF1Q10570 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CPSF1Q10570 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CPSF1Q10570 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CPSF1Q10570 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CPSF1Q10570 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CPSF1Q10570 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
CPSF1Q10570 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
CPSF1Q10570 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CPSF1Q10570 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
CPSF1Q10570 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CPSF1Q10570 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CPSF1Q10570 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CPSF1Q10570 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CPSF1Q10570 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CPSF1Q10570 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CPSF1Q10570 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CPSF1Q10570 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CPSF1Q10570 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CPSF1Q10570 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CPSF1Q10570 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CPSF1Q10570 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CPSF1Q10570 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CPSF1Q10570 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CPSF1Q10570 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CPSF1Q10570 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CPSF1Q10570 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CPSF1Q10570 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CPSF1Q10570 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CPSF1Q10570 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CPSF1Q10570 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CPSF1Q10570 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
CPSF1Q10570 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CPSF1Q10570 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
CPSF1Q10570 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CPSF1Q10570 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CPSF1Q10570 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CPSF1Q10570 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CPSF1Q10570 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
CPSF1Q10570 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
CPSF1Q10570 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
CPSF1Q10570 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
CPSF1Q10570 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
CPSF1Q10570 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
CPSF1Q10570 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
CPSF1Q10570 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.03
CPSF1Q10570 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC27.7■■■□□ 2.03
CPSF1Q10570 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
CPSF1Q10570 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.03
CPSF1Q10570 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
CPSF1Q10570 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CPSF1Q10570 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
CPSF1Q10570 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
CPSF1Q10570 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CPSF1Q10570 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CPSF1Q10570 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CPSF1Q10570 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CPSF1Q10570 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CPSF1Q10570 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CPSF1Q10570 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CPSF1Q10570 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CPSF1Q10570 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
CPSF1Q10570 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CPSF1Q10570 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CPSF1Q10570 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CPSF1Q10570 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CPSF1Q10570 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CPSF1Q10570 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CPSF1Q10570 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CPSF1Q10570 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CPSF1Q10570 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
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