Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2K3

RIPPLY1, Protein ripply1, humanhuman

Predictions only

Length 151 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIPPLY1Q0D2K3 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RIPPLY1Q0D2K3 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RIPPLY1Q0D2K3 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RIPPLY1Q0D2K3 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RIPPLY1Q0D2K3 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RIPPLY1Q0D2K3 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RIPPLY1Q0D2K3 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RIPPLY1Q0D2K3 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RIPPLY1Q0D2K3 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RIPPLY1Q0D2K3 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RIPPLY1Q0D2K3 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RIPPLY1Q0D2K3 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RIPPLY1Q0D2K3 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RIPPLY1Q0D2K3 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RIPPLY1Q0D2K3 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RIPPLY1Q0D2K3 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RIPPLY1Q0D2K3 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RIPPLY1Q0D2K3 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RIPPLY1Q0D2K3 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RIPPLY1Q0D2K3 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RIPPLY1Q0D2K3 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RIPPLY1Q0D2K3 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RIPPLY1Q0D2K3 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RIPPLY1Q0D2K3 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RIPPLY1Q0D2K3 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RIPPLY1Q0D2K3 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RIPPLY1Q0D2K3 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RIPPLY1Q0D2K3 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RIPPLY1Q0D2K3 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RIPPLY1Q0D2K3 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RIPPLY1Q0D2K3 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RIPPLY1Q0D2K3 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RIPPLY1Q0D2K3 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
RIPPLY1Q0D2K3 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
RIPPLY1Q0D2K3 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RIPPLY1Q0D2K3 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RIPPLY1Q0D2K3 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RIPPLY1Q0D2K3 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RIPPLY1Q0D2K3 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RIPPLY1Q0D2K3 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RIPPLY1Q0D2K3 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RIPPLY1Q0D2K3 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RIPPLY1Q0D2K3 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RIPPLY1Q0D2K3 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RIPPLY1Q0D2K3 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RIPPLY1Q0D2K3 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RIPPLY1Q0D2K3 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RIPPLY1Q0D2K3 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RIPPLY1Q0D2K3 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RIPPLY1Q0D2K3 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RIPPLY1Q0D2K3 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RIPPLY1Q0D2K3 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RIPPLY1Q0D2K3 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RIPPLY1Q0D2K3 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RIPPLY1Q0D2K3 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
RIPPLY1Q0D2K3 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RIPPLY1Q0D2K3 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RIPPLY1Q0D2K3 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RIPPLY1Q0D2K3 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RIPPLY1Q0D2K3 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RIPPLY1Q0D2K3 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RIPPLY1Q0D2K3 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RIPPLY1Q0D2K3 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RIPPLY1Q0D2K3 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RIPPLY1Q0D2K3 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RIPPLY1Q0D2K3 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RIPPLY1Q0D2K3 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RIPPLY1Q0D2K3 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RIPPLY1Q0D2K3 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RIPPLY1Q0D2K3 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RIPPLY1Q0D2K3 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
RIPPLY1Q0D2K3 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RIPPLY1Q0D2K3 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RIPPLY1Q0D2K3 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RIPPLY1Q0D2K3 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RIPPLY1Q0D2K3 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RIPPLY1Q0D2K3 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RIPPLY1Q0D2K3 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RIPPLY1Q0D2K3 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RIPPLY1Q0D2K3 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RIPPLY1Q0D2K3 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RIPPLY1Q0D2K3 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RIPPLY1Q0D2K3 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RIPPLY1Q0D2K3 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RIPPLY1Q0D2K3 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RIPPLY1Q0D2K3 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RIPPLY1Q0D2K3 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RIPPLY1Q0D2K3 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RIPPLY1Q0D2K3 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RIPPLY1Q0D2K3 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RIPPLY1Q0D2K3 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RIPPLY1Q0D2K3 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RIPPLY1Q0D2K3 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
RIPPLY1Q0D2K3 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RIPPLY1Q0D2K3 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RIPPLY1Q0D2K3 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RIPPLY1Q0D2K3 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RIPPLY1Q0D2K3 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RIPPLY1Q0D2K3 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RIPPLY1Q0D2K3 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms