Protein–RNA interactions for Protein: Q08AI8

C2orf54, Uncharacterized protein C2orf54, humanhuman

Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C2orf54Q08AI8 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
C2orf54Q08AI8 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
C2orf54Q08AI8 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
C2orf54Q08AI8 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
C2orf54Q08AI8 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
C2orf54Q08AI8 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
C2orf54Q08AI8 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
C2orf54Q08AI8 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
C2orf54Q08AI8 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
C2orf54Q08AI8 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
C2orf54Q08AI8 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
C2orf54Q08AI8 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
C2orf54Q08AI8 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
C2orf54Q08AI8 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
C2orf54Q08AI8 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
C2orf54Q08AI8 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
C2orf54Q08AI8 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
C2orf54Q08AI8 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
C2orf54Q08AI8 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
C2orf54Q08AI8 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
C2orf54Q08AI8 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
C2orf54Q08AI8 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
C2orf54Q08AI8 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
C2orf54Q08AI8 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
C2orf54Q08AI8 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC21.27■■□□□ 1
C2orf54Q08AI8 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
C2orf54Q08AI8 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC21.27■■□□□ 1
C2orf54Q08AI8 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC21.27■■□□□ 1
C2orf54Q08AI8 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
C2orf54Q08AI8 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
C2orf54Q08AI8 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
C2orf54Q08AI8 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
C2orf54Q08AI8 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
C2orf54Q08AI8 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
C2orf54Q08AI8 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
C2orf54Q08AI8 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
C2orf54Q08AI8 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
C2orf54Q08AI8 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
C2orf54Q08AI8 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
C2orf54Q08AI8 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
C2orf54Q08AI8 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
C2orf54Q08AI8 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
C2orf54Q08AI8 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
C2orf54Q08AI8 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
C2orf54Q08AI8 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
C2orf54Q08AI8 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
C2orf54Q08AI8 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
C2orf54Q08AI8 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
C2orf54Q08AI8 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
C2orf54Q08AI8 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
C2orf54Q08AI8 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
C2orf54Q08AI8 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
C2orf54Q08AI8 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
C2orf54Q08AI8 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
C2orf54Q08AI8 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
C2orf54Q08AI8 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
C2orf54Q08AI8 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
C2orf54Q08AI8 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
C2orf54Q08AI8 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
C2orf54Q08AI8 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
C2orf54Q08AI8 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
C2orf54Q08AI8 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
C2orf54Q08AI8 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
C2orf54Q08AI8 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
C2orf54Q08AI8 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
C2orf54Q08AI8 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
C2orf54Q08AI8 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
C2orf54Q08AI8 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
C2orf54Q08AI8 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
C2orf54Q08AI8 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
C2orf54Q08AI8 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
C2orf54Q08AI8 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
C2orf54Q08AI8 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
C2orf54Q08AI8 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
C2orf54Q08AI8 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
C2orf54Q08AI8 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
C2orf54Q08AI8 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
C2orf54Q08AI8 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
C2orf54Q08AI8 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
C2orf54Q08AI8 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
C2orf54Q08AI8 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
C2orf54Q08AI8 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
C2orf54Q08AI8 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
C2orf54Q08AI8 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
C2orf54Q08AI8 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
C2orf54Q08AI8 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
C2orf54Q08AI8 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
C2orf54Q08AI8 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
C2orf54Q08AI8 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
C2orf54Q08AI8 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
C2orf54Q08AI8 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
C2orf54Q08AI8 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
C2orf54Q08AI8 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
C2orf54Q08AI8 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
C2orf54Q08AI8 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
C2orf54Q08AI8 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
C2orf54Q08AI8 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
C2orf54Q08AI8 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
C2orf54Q08AI8 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
C2orf54Q08AI8 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms