Protein–RNA interactions for Protein: Q08477

CYP4F3, Docosahexaenoic acid omega-hydroxylase CYP4F3, humanhuman

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP4F3Q08477 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CYP4F3Q08477 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CYP4F3Q08477 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CYP4F3Q08477 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CYP4F3Q08477 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CYP4F3Q08477 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CYP4F3Q08477 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CYP4F3Q08477 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CYP4F3Q08477 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CYP4F3Q08477 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CYP4F3Q08477 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CYP4F3Q08477 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CYP4F3Q08477 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CYP4F3Q08477 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CYP4F3Q08477 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CYP4F3Q08477 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CYP4F3Q08477 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CYP4F3Q08477 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CYP4F3Q08477 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CYP4F3Q08477 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CYP4F3Q08477 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CYP4F3Q08477 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
CYP4F3Q08477 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
CYP4F3Q08477 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CYP4F3Q08477 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CYP4F3Q08477 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CYP4F3Q08477 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CYP4F3Q08477 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CYP4F3Q08477 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CYP4F3Q08477 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CYP4F3Q08477 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CYP4F3Q08477 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CYP4F3Q08477 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CYP4F3Q08477 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CYP4F3Q08477 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CYP4F3Q08477 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CYP4F3Q08477 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CYP4F3Q08477 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CYP4F3Q08477 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CYP4F3Q08477 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CYP4F3Q08477 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CYP4F3Q08477 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CYP4F3Q08477 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CYP4F3Q08477 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CYP4F3Q08477 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CYP4F3Q08477 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CYP4F3Q08477 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CYP4F3Q08477 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CYP4F3Q08477 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CYP4F3Q08477 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CYP4F3Q08477 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CYP4F3Q08477 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CYP4F3Q08477 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CYP4F3Q08477 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CYP4F3Q08477 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CYP4F3Q08477 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CYP4F3Q08477 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CYP4F3Q08477 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CYP4F3Q08477 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CYP4F3Q08477 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CYP4F3Q08477 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CYP4F3Q08477 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CYP4F3Q08477 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CYP4F3Q08477 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CYP4F3Q08477 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CYP4F3Q08477 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CYP4F3Q08477 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CYP4F3Q08477 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CYP4F3Q08477 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CYP4F3Q08477 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CYP4F3Q08477 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CYP4F3Q08477 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CYP4F3Q08477 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CYP4F3Q08477 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CYP4F3Q08477 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CYP4F3Q08477 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CYP4F3Q08477 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CYP4F3Q08477 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CYP4F3Q08477 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CYP4F3Q08477 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CYP4F3Q08477 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CYP4F3Q08477 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CYP4F3Q08477 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CYP4F3Q08477 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CYP4F3Q08477 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CYP4F3Q08477 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CYP4F3Q08477 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CYP4F3Q08477 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CYP4F3Q08477 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CYP4F3Q08477 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CYP4F3Q08477 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CYP4F3Q08477 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CYP4F3Q08477 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CYP4F3Q08477 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CYP4F3Q08477 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CYP4F3Q08477 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CYP4F3Q08477 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CYP4F3Q08477 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
CYP4F3Q08477 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
CYP4F3Q08477 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms