Protein–RNA interactions for Protein: Q08345

DDR1, Epithelial discoidin domain-containing receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 913 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDR1Q08345 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
DDR1Q08345 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
DDR1Q08345 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
DDR1Q08345 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
DDR1Q08345 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
DDR1Q08345 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
DDR1Q08345 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
DDR1Q08345 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
DDR1Q08345 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
DDR1Q08345 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
DDR1Q08345 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
DDR1Q08345 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
DDR1Q08345 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
DDR1Q08345 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC25.47■■□□□ 1.67
DDR1Q08345 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
DDR1Q08345 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
DDR1Q08345 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
DDR1Q08345 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
DDR1Q08345 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
DDR1Q08345 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
DDR1Q08345 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
DDR1Q08345 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
DDR1Q08345 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
DDR1Q08345 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
DDR1Q08345 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
DDR1Q08345 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
DDR1Q08345 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
DDR1Q08345 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
DDR1Q08345 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
DDR1Q08345 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
DDR1Q08345 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
DDR1Q08345 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
DDR1Q08345 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
DDR1Q08345 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
DDR1Q08345 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
DDR1Q08345 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
DDR1Q08345 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
DDR1Q08345 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
DDR1Q08345 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
DDR1Q08345 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
DDR1Q08345 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
DDR1Q08345 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
DDR1Q08345 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
DDR1Q08345 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC25.45■■□□□ 1.66
DDR1Q08345 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
DDR1Q08345 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
DDR1Q08345 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
DDR1Q08345 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
DDR1Q08345 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
DDR1Q08345 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
DDR1Q08345 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
DDR1Q08345 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
DDR1Q08345 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
DDR1Q08345 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
DDR1Q08345 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
DDR1Q08345 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
DDR1Q08345 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
DDR1Q08345 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
DDR1Q08345 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
DDR1Q08345 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
DDR1Q08345 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
DDR1Q08345 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
DDR1Q08345 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
DDR1Q08345 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
DDR1Q08345 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
DDR1Q08345 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
DDR1Q08345 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
DDR1Q08345 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
DDR1Q08345 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
DDR1Q08345 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
DDR1Q08345 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
DDR1Q08345 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
DDR1Q08345 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
DDR1Q08345 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
DDR1Q08345 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
DDR1Q08345 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
DDR1Q08345 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
DDR1Q08345 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
DDR1Q08345 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
DDR1Q08345 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
DDR1Q08345 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
DDR1Q08345 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
DDR1Q08345 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
DDR1Q08345 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
DDR1Q08345 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
DDR1Q08345 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
DDR1Q08345 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
DDR1Q08345 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
DDR1Q08345 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
DDR1Q08345 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
DDR1Q08345 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
DDR1Q08345 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
DDR1Q08345 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
DDR1Q08345 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
DDR1Q08345 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
DDR1Q08345 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
DDR1Q08345 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
DDR1Q08345 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
DDR1Q08345 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
DDR1Q08345 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms