Protein–RNA interactions for Protein: Q07954

LRP1, Prolow-density lipoprotein receptor-related protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 4,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP1Q07954 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
LRP1Q07954 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
LRP1Q07954 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
LRP1Q07954 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
LRP1Q07954 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
LRP1Q07954 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
LRP1Q07954 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC12.12□□□□□ -0.47
LRP1Q07954 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
LRP1Q07954 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
LRP1Q07954 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC12.12□□□□□ -0.47
LRP1Q07954 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
LRP1Q07954 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
LRP1Q07954 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
LRP1Q07954 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
LRP1Q07954 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
LRP1Q07954 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
LRP1Q07954 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
LRP1Q07954 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
LRP1Q07954 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
LRP1Q07954 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
LRP1Q07954 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
LRP1Q07954 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
LRP1Q07954 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
LRP1Q07954 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
LRP1Q07954 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
LRP1Q07954 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
LRP1Q07954 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
LRP1Q07954 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC12.12□□□□□ -0.47
LRP1Q07954 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
LRP1Q07954 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
LRP1Q07954 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
LRP1Q07954 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
LRP1Q07954 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC12.11□□□□□ -0.47
LRP1Q07954 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
LRP1Q07954 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
LRP1Q07954 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
LRP1Q07954 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
LRP1Q07954 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
LRP1Q07954 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
LRP1Q07954 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC12.11□□□□□ -0.47
LRP1Q07954 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
LRP1Q07954 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
LRP1Q07954 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
LRP1Q07954 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
LRP1Q07954 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
LRP1Q07954 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
LRP1Q07954 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
LRP1Q07954 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
LRP1Q07954 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
LRP1Q07954 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
LRP1Q07954 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
LRP1Q07954 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
LRP1Q07954 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC12.11□□□□□ -0.47
LRP1Q07954 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
LRP1Q07954 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC12.11□□□□□ -0.47
LRP1Q07954 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
LRP1Q07954 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
LRP1Q07954 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
LRP1Q07954 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
LRP1Q07954 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
LRP1Q07954 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
LRP1Q07954 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
LRP1Q07954 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
LRP1Q07954 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
LRP1Q07954 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
LRP1Q07954 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
LRP1Q07954 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC12.1□□□□□ -0.47
LRP1Q07954 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
LRP1Q07954 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
LRP1Q07954 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
LRP1Q07954 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
LRP1Q07954 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
LRP1Q07954 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
LRP1Q07954 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
LRP1Q07954 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
LRP1Q07954 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
LRP1Q07954 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
LRP1Q07954 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
LRP1Q07954 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
LRP1Q07954 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
LRP1Q07954 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
LRP1Q07954 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
LRP1Q07954 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
LRP1Q07954 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
LRP1Q07954 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
LRP1Q07954 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
LRP1Q07954 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
LRP1Q07954 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
LRP1Q07954 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
LRP1Q07954 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
LRP1Q07954 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
LRP1Q07954 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
LRP1Q07954 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
LRP1Q07954 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
LRP1Q07954 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
LRP1Q07954 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
LRP1Q07954 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
LRP1Q07954 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
LRP1Q07954 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
LRP1Q07954 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms