Protein–RNA interactions for Protein: Q07654

TFF3, Trefoil factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 80 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFF3Q07654 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TFF3Q07654 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TFF3Q07654 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
TFF3Q07654 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TFF3Q07654 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TFF3Q07654 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TFF3Q07654 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TFF3Q07654 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TFF3Q07654 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TFF3Q07654 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TFF3Q07654 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TFF3Q07654 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TFF3Q07654 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TFF3Q07654 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TFF3Q07654 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
TFF3Q07654 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
TFF3Q07654 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TFF3Q07654 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TFF3Q07654 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TFF3Q07654 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TFF3Q07654 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TFF3Q07654 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TFF3Q07654 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TFF3Q07654 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TFF3Q07654 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TFF3Q07654 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TFF3Q07654 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TFF3Q07654 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
TFF3Q07654 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
TFF3Q07654 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
TFF3Q07654 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
TFF3Q07654 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TFF3Q07654 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TFF3Q07654 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TFF3Q07654 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TFF3Q07654 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TFF3Q07654 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TFF3Q07654 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TFF3Q07654 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TFF3Q07654 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TFF3Q07654 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TFF3Q07654 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TFF3Q07654 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TFF3Q07654 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TFF3Q07654 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TFF3Q07654 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TFF3Q07654 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TFF3Q07654 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TFF3Q07654 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TFF3Q07654 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TFF3Q07654 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
TFF3Q07654 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TFF3Q07654 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TFF3Q07654 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TFF3Q07654 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
TFF3Q07654 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
TFF3Q07654 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TFF3Q07654 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TFF3Q07654 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TFF3Q07654 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TFF3Q07654 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TFF3Q07654 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TFF3Q07654 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TFF3Q07654 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TFF3Q07654 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TFF3Q07654 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TFF3Q07654 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TFF3Q07654 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TFF3Q07654 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
TFF3Q07654 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TFF3Q07654 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TFF3Q07654 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TFF3Q07654 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TFF3Q07654 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TFF3Q07654 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TFF3Q07654 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TFF3Q07654 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TFF3Q07654 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TFF3Q07654 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TFF3Q07654 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TFF3Q07654 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TFF3Q07654 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TFF3Q07654 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TFF3Q07654 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TFF3Q07654 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TFF3Q07654 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TFF3Q07654 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TFF3Q07654 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TFF3Q07654 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TFF3Q07654 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TFF3Q07654 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TFF3Q07654 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TFF3Q07654 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TFF3Q07654 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
TFF3Q07654 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TFF3Q07654 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TFF3Q07654 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TFF3Q07654 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
TFF3Q07654 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TFF3Q07654 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms