Protein–RNA interactions for Protein: Q07092

COL16A1, Collagen alpha-1(XVI) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL16A1Q07092 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
COL16A1Q07092 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
COL16A1Q07092 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
COL16A1Q07092 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
COL16A1Q07092 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
COL16A1Q07092 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
COL16A1Q07092 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
COL16A1Q07092 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
COL16A1Q07092 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
COL16A1Q07092 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
COL16A1Q07092 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
COL16A1Q07092 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
COL16A1Q07092 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
COL16A1Q07092 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
COL16A1Q07092 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
COL16A1Q07092 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
COL16A1Q07092 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
COL16A1Q07092 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
COL16A1Q07092 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
COL16A1Q07092 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
COL16A1Q07092 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
COL16A1Q07092 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
COL16A1Q07092 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
COL16A1Q07092 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
COL16A1Q07092 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
COL16A1Q07092 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
COL16A1Q07092 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
COL16A1Q07092 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
COL16A1Q07092 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
COL16A1Q07092 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
COL16A1Q07092 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
COL16A1Q07092 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
COL16A1Q07092 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
COL16A1Q07092 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
COL16A1Q07092 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
COL16A1Q07092 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
COL16A1Q07092 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
COL16A1Q07092 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
COL16A1Q07092 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
COL16A1Q07092 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
COL16A1Q07092 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
COL16A1Q07092 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC27.74■■■□□ 2.03
COL16A1Q07092 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
COL16A1Q07092 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
COL16A1Q07092 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
COL16A1Q07092 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
COL16A1Q07092 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
COL16A1Q07092 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
COL16A1Q07092 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
COL16A1Q07092 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC27.74■■■□□ 2.03
COL16A1Q07092 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC27.74■■■□□ 2.03
COL16A1Q07092 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
COL16A1Q07092 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
COL16A1Q07092 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
COL16A1Q07092 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
COL16A1Q07092 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
COL16A1Q07092 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
COL16A1Q07092 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
COL16A1Q07092 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
COL16A1Q07092 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
COL16A1Q07092 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC27.74■■■□□ 2.03
COL16A1Q07092 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
COL16A1Q07092 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
COL16A1Q07092 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
COL16A1Q07092 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
COL16A1Q07092 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
COL16A1Q07092 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
COL16A1Q07092 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
COL16A1Q07092 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
COL16A1Q07092 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
COL16A1Q07092 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
COL16A1Q07092 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
COL16A1Q07092 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
COL16A1Q07092 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
COL16A1Q07092 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
COL16A1Q07092 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
COL16A1Q07092 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
COL16A1Q07092 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
COL16A1Q07092 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
COL16A1Q07092 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
COL16A1Q07092 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
COL16A1Q07092 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
COL16A1Q07092 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
COL16A1Q07092 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
COL16A1Q07092 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
COL16A1Q07092 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
COL16A1Q07092 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
COL16A1Q07092 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
COL16A1Q07092 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
COL16A1Q07092 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
COL16A1Q07092 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
COL16A1Q07092 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
COL16A1Q07092 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
COL16A1Q07092 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
COL16A1Q07092 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC27.71■■■□□ 2.03
COL16A1Q07092 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
COL16A1Q07092 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
COL16A1Q07092 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
COL16A1Q07092 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
COL16A1Q07092 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms