Protein–RNA interactions for Protein: Q06136

KDSR, 3-ketodihydrosphingosine reductase, humanhuman

Predictions only

Length 332 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDSRQ06136 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
KDSRQ06136 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
KDSRQ06136 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
KDSRQ06136 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
KDSRQ06136 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
KDSRQ06136 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
KDSRQ06136 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
KDSRQ06136 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
KDSRQ06136 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
KDSRQ06136 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
KDSRQ06136 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
KDSRQ06136 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
KDSRQ06136 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
KDSRQ06136 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
KDSRQ06136 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
KDSRQ06136 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
KDSRQ06136 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
KDSRQ06136 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
KDSRQ06136 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
KDSRQ06136 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
KDSRQ06136 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
KDSRQ06136 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
KDSRQ06136 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
KDSRQ06136 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
KDSRQ06136 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
KDSRQ06136 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
KDSRQ06136 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
KDSRQ06136 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
KDSRQ06136 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
KDSRQ06136 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
KDSRQ06136 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
KDSRQ06136 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
KDSRQ06136 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
KDSRQ06136 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
KDSRQ06136 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
KDSRQ06136 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
KDSRQ06136 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
KDSRQ06136 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
KDSRQ06136 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
KDSRQ06136 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
KDSRQ06136 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
KDSRQ06136 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
KDSRQ06136 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
KDSRQ06136 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
KDSRQ06136 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
KDSRQ06136 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
KDSRQ06136 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
KDSRQ06136 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
KDSRQ06136 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
KDSRQ06136 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
KDSRQ06136 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
KDSRQ06136 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
KDSRQ06136 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
KDSRQ06136 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
KDSRQ06136 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
KDSRQ06136 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
KDSRQ06136 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
KDSRQ06136 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
KDSRQ06136 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
KDSRQ06136 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
KDSRQ06136 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
KDSRQ06136 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
KDSRQ06136 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
KDSRQ06136 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
KDSRQ06136 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
KDSRQ06136 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
KDSRQ06136 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
KDSRQ06136 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
KDSRQ06136 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
KDSRQ06136 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
KDSRQ06136 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
KDSRQ06136 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
KDSRQ06136 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
KDSRQ06136 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
KDSRQ06136 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
KDSRQ06136 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
KDSRQ06136 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
KDSRQ06136 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
KDSRQ06136 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
KDSRQ06136 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
KDSRQ06136 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
KDSRQ06136 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
KDSRQ06136 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
KDSRQ06136 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
KDSRQ06136 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
KDSRQ06136 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
KDSRQ06136 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
KDSRQ06136 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
KDSRQ06136 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
KDSRQ06136 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
KDSRQ06136 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
KDSRQ06136 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
KDSRQ06136 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
KDSRQ06136 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
KDSRQ06136 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
KDSRQ06136 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
KDSRQ06136 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
KDSRQ06136 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
KDSRQ06136 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
KDSRQ06136 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.5 ms