Protein–RNA interactions for Protein: Q05D32

CTDSPL2, CTD small phosphatase-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSPL2Q05D32 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CTDSPL2Q05D32 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CTDSPL2Q05D32 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CTDSPL2Q05D32 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CTDSPL2Q05D32 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CTDSPL2Q05D32 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CTDSPL2Q05D32 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CTDSPL2Q05D32 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CTDSPL2Q05D32 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CTDSPL2Q05D32 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CTDSPL2Q05D32 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CTDSPL2Q05D32 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CTDSPL2Q05D32 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CTDSPL2Q05D32 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CTDSPL2Q05D32 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CTDSPL2Q05D32 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CTDSPL2Q05D32 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CTDSPL2Q05D32 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CTDSPL2Q05D32 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CTDSPL2Q05D32 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CTDSPL2Q05D32 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CTDSPL2Q05D32 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CTDSPL2Q05D32 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CTDSPL2Q05D32 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CTDSPL2Q05D32 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CTDSPL2Q05D32 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CTDSPL2Q05D32 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CTDSPL2Q05D32 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CTDSPL2Q05D32 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CTDSPL2Q05D32 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CTDSPL2Q05D32 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CTDSPL2Q05D32 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CTDSPL2Q05D32 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CTDSPL2Q05D32 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CTDSPL2Q05D32 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CTDSPL2Q05D32 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CTDSPL2Q05D32 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CTDSPL2Q05D32 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CTDSPL2Q05D32 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CTDSPL2Q05D32 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CTDSPL2Q05D32 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CTDSPL2Q05D32 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CTDSPL2Q05D32 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CTDSPL2Q05D32 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CTDSPL2Q05D32 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CTDSPL2Q05D32 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CTDSPL2Q05D32 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CTDSPL2Q05D32 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CTDSPL2Q05D32 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CTDSPL2Q05D32 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CTDSPL2Q05D32 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CTDSPL2Q05D32 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CTDSPL2Q05D32 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CTDSPL2Q05D32 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CTDSPL2Q05D32 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CTDSPL2Q05D32 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CTDSPL2Q05D32 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CTDSPL2Q05D32 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CTDSPL2Q05D32 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CTDSPL2Q05D32 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CTDSPL2Q05D32 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CTDSPL2Q05D32 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CTDSPL2Q05D32 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CTDSPL2Q05D32 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CTDSPL2Q05D32 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CTDSPL2Q05D32 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CTDSPL2Q05D32 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CTDSPL2Q05D32 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CTDSPL2Q05D32 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CTDSPL2Q05D32 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CTDSPL2Q05D32 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CTDSPL2Q05D32 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CTDSPL2Q05D32 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CTDSPL2Q05D32 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CTDSPL2Q05D32 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CTDSPL2Q05D32 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CTDSPL2Q05D32 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CTDSPL2Q05D32 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CTDSPL2Q05D32 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CTDSPL2Q05D32 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CTDSPL2Q05D32 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CTDSPL2Q05D32 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CTDSPL2Q05D32 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CTDSPL2Q05D32 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CTDSPL2Q05D32 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CTDSPL2Q05D32 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CTDSPL2Q05D32 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CTDSPL2Q05D32 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CTDSPL2Q05D32 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CTDSPL2Q05D32 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CTDSPL2Q05D32 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CTDSPL2Q05D32 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CTDSPL2Q05D32 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CTDSPL2Q05D32 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CTDSPL2Q05D32 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CTDSPL2Q05D32 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
CTDSPL2Q05D32 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CTDSPL2Q05D32 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CTDSPL2Q05D32 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CTDSPL2Q05D32 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms