Protein–RNA interactions for Protein: Q04837

SSBP1, Single-stranded DNA-binding protein, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSBP1Q04837 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SSBP1Q04837 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SSBP1Q04837 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SSBP1Q04837 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
SSBP1Q04837 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SSBP1Q04837 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SSBP1Q04837 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SSBP1Q04837 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SSBP1Q04837 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SSBP1Q04837 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
SSBP1Q04837 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SSBP1Q04837 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SSBP1Q04837 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SSBP1Q04837 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SSBP1Q04837 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SSBP1Q04837 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SSBP1Q04837 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SSBP1Q04837 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SSBP1Q04837 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SSBP1Q04837 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SSBP1Q04837 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SSBP1Q04837 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SSBP1Q04837 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SSBP1Q04837 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SSBP1Q04837 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SSBP1Q04837 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
SSBP1Q04837 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SSBP1Q04837 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SSBP1Q04837 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SSBP1Q04837 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SSBP1Q04837 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SSBP1Q04837 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SSBP1Q04837 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SSBP1Q04837 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SSBP1Q04837 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SSBP1Q04837 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SSBP1Q04837 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SSBP1Q04837 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SSBP1Q04837 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SSBP1Q04837 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SSBP1Q04837 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SSBP1Q04837 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SSBP1Q04837 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SSBP1Q04837 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SSBP1Q04837 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SSBP1Q04837 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SSBP1Q04837 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SSBP1Q04837 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SSBP1Q04837 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SSBP1Q04837 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SSBP1Q04837 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SSBP1Q04837 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SSBP1Q04837 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SSBP1Q04837 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SSBP1Q04837 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SSBP1Q04837 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SSBP1Q04837 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SSBP1Q04837 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SSBP1Q04837 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SSBP1Q04837 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SSBP1Q04837 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SSBP1Q04837 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SSBP1Q04837 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SSBP1Q04837 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SSBP1Q04837 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SSBP1Q04837 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SSBP1Q04837 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SSBP1Q04837 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SSBP1Q04837 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SSBP1Q04837 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SSBP1Q04837 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SSBP1Q04837 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SSBP1Q04837 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SSBP1Q04837 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SSBP1Q04837 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SSBP1Q04837 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SSBP1Q04837 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SSBP1Q04837 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SSBP1Q04837 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SSBP1Q04837 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SSBP1Q04837 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SSBP1Q04837 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SSBP1Q04837 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SSBP1Q04837 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SSBP1Q04837 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.34
SSBP1Q04837 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
SSBP1Q04837 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SSBP1Q04837 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SSBP1Q04837 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SSBP1Q04837 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SSBP1Q04837 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SSBP1Q04837 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SSBP1Q04837 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SSBP1Q04837 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SSBP1Q04837 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SSBP1Q04837 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SSBP1Q04837 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SSBP1Q04837 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SSBP1Q04837 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SSBP1Q04837 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms