Protein–RNA interactions for Protein: Q02818

NUCB1, Nucleobindin-1, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUCB1Q02818 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NUCB1Q02818 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.12■■□□□ 1.61
NUCB1Q02818 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
NUCB1Q02818 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NUCB1Q02818 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NUCB1Q02818 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
NUCB1Q02818 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
NUCB1Q02818 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
NUCB1Q02818 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
NUCB1Q02818 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
NUCB1Q02818 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
NUCB1Q02818 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NUCB1Q02818 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NUCB1Q02818 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
NUCB1Q02818 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NUCB1Q02818 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
NUCB1Q02818 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NUCB1Q02818 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
NUCB1Q02818 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
NUCB1Q02818 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
NUCB1Q02818 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NUCB1Q02818 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NUCB1Q02818 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
NUCB1Q02818 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NUCB1Q02818 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
NUCB1Q02818 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
NUCB1Q02818 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NUCB1Q02818 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NUCB1Q02818 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NUCB1Q02818 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
NUCB1Q02818 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NUCB1Q02818 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
NUCB1Q02818 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NUCB1Q02818 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NUCB1Q02818 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NUCB1Q02818 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NUCB1Q02818 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
NUCB1Q02818 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
NUCB1Q02818 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NUCB1Q02818 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NUCB1Q02818 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NUCB1Q02818 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
NUCB1Q02818 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
NUCB1Q02818 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
NUCB1Q02818 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC25.1■■□□□ 1.61
NUCB1Q02818 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC25.1■■□□□ 1.61
NUCB1Q02818 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
NUCB1Q02818 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
NUCB1Q02818 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
NUCB1Q02818 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NUCB1Q02818 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NUCB1Q02818 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NUCB1Q02818 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NUCB1Q02818 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
NUCB1Q02818 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
NUCB1Q02818 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NUCB1Q02818 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
NUCB1Q02818 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NUCB1Q02818 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
NUCB1Q02818 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
NUCB1Q02818 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NUCB1Q02818 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
NUCB1Q02818 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
NUCB1Q02818 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
NUCB1Q02818 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NUCB1Q02818 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NUCB1Q02818 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NUCB1Q02818 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
NUCB1Q02818 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
NUCB1Q02818 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
NUCB1Q02818 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
NUCB1Q02818 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
NUCB1Q02818 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
NUCB1Q02818 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
NUCB1Q02818 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
NUCB1Q02818 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
NUCB1Q02818 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
NUCB1Q02818 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
NUCB1Q02818 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
NUCB1Q02818 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
NUCB1Q02818 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
NUCB1Q02818 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
NUCB1Q02818 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NUCB1Q02818 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NUCB1Q02818 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC25.07■■□□□ 1.6
NUCB1Q02818 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NUCB1Q02818 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
NUCB1Q02818 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
NUCB1Q02818 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NUCB1Q02818 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
NUCB1Q02818 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
NUCB1Q02818 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NUCB1Q02818 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NUCB1Q02818 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NUCB1Q02818 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
NUCB1Q02818 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NUCB1Q02818 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
NUCB1Q02818 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
NUCB1Q02818 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
NUCB1Q02818 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms