Protein–RNA interactions for Protein: Q02539

HIST1H1A, Histone H1.1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIST1H1AQ02539 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HIST1H1AQ02539 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HIST1H1AQ02539 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HIST1H1AQ02539 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HIST1H1AQ02539 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
HIST1H1AQ02539 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HIST1H1AQ02539 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
HIST1H1AQ02539 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HIST1H1AQ02539 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HIST1H1AQ02539 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HIST1H1AQ02539 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HIST1H1AQ02539 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HIST1H1AQ02539 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HIST1H1AQ02539 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HIST1H1AQ02539 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HIST1H1AQ02539 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HIST1H1AQ02539 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HIST1H1AQ02539 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
HIST1H1AQ02539 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
HIST1H1AQ02539 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HIST1H1AQ02539 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HIST1H1AQ02539 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HIST1H1AQ02539 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HIST1H1AQ02539 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HIST1H1AQ02539 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HIST1H1AQ02539 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HIST1H1AQ02539 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HIST1H1AQ02539 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HIST1H1AQ02539 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HIST1H1AQ02539 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HIST1H1AQ02539 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HIST1H1AQ02539 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HIST1H1AQ02539 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HIST1H1AQ02539 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HIST1H1AQ02539 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HIST1H1AQ02539 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HIST1H1AQ02539 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HIST1H1AQ02539 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HIST1H1AQ02539 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HIST1H1AQ02539 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HIST1H1AQ02539 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HIST1H1AQ02539 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HIST1H1AQ02539 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HIST1H1AQ02539 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HIST1H1AQ02539 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HIST1H1AQ02539 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HIST1H1AQ02539 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HIST1H1AQ02539 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HIST1H1AQ02539 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HIST1H1AQ02539 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HIST1H1AQ02539 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HIST1H1AQ02539 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HIST1H1AQ02539 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HIST1H1AQ02539 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HIST1H1AQ02539 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HIST1H1AQ02539 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HIST1H1AQ02539 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HIST1H1AQ02539 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HIST1H1AQ02539 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HIST1H1AQ02539 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HIST1H1AQ02539 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HIST1H1AQ02539 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HIST1H1AQ02539 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HIST1H1AQ02539 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HIST1H1AQ02539 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HIST1H1AQ02539 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HIST1H1AQ02539 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HIST1H1AQ02539 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HIST1H1AQ02539 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HIST1H1AQ02539 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HIST1H1AQ02539 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HIST1H1AQ02539 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HIST1H1AQ02539 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HIST1H1AQ02539 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HIST1H1AQ02539 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HIST1H1AQ02539 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HIST1H1AQ02539 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HIST1H1AQ02539 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HIST1H1AQ02539 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HIST1H1AQ02539 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HIST1H1AQ02539 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HIST1H1AQ02539 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HIST1H1AQ02539 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
HIST1H1AQ02539 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
HIST1H1AQ02539 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
HIST1H1AQ02539 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
HIST1H1AQ02539 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
HIST1H1AQ02539 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
HIST1H1AQ02539 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HIST1H1AQ02539 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HIST1H1AQ02539 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HIST1H1AQ02539 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HIST1H1AQ02539 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HIST1H1AQ02539 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
HIST1H1AQ02539 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HIST1H1AQ02539 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HIST1H1AQ02539 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HIST1H1AQ02539 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HIST1H1AQ02539 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HIST1H1AQ02539 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms