Protein–RNA interactions for Protein: Q02509

OC90, Otoconin-90, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OC90Q02509 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
OC90Q02509 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
OC90Q02509 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
OC90Q02509 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
OC90Q02509 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
OC90Q02509 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
OC90Q02509 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
OC90Q02509 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
OC90Q02509 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
OC90Q02509 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
OC90Q02509 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
OC90Q02509 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
OC90Q02509 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
OC90Q02509 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
OC90Q02509 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
OC90Q02509 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
OC90Q02509 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
OC90Q02509 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
OC90Q02509 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
OC90Q02509 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
OC90Q02509 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
OC90Q02509 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
OC90Q02509 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
OC90Q02509 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
OC90Q02509 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
OC90Q02509 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
OC90Q02509 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
OC90Q02509 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
OC90Q02509 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
OC90Q02509 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
OC90Q02509 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
OC90Q02509 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
OC90Q02509 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
OC90Q02509 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
OC90Q02509 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
OC90Q02509 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
OC90Q02509 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
OC90Q02509 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
OC90Q02509 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
OC90Q02509 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
OC90Q02509 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
OC90Q02509 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
OC90Q02509 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
OC90Q02509 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
OC90Q02509 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
OC90Q02509 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
OC90Q02509 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
OC90Q02509 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
OC90Q02509 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
OC90Q02509 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
OC90Q02509 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
OC90Q02509 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
OC90Q02509 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
OC90Q02509 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
OC90Q02509 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
OC90Q02509 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
OC90Q02509 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
OC90Q02509 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
OC90Q02509 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
OC90Q02509 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
OC90Q02509 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
OC90Q02509 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
OC90Q02509 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
OC90Q02509 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
OC90Q02509 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
OC90Q02509 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
OC90Q02509 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
OC90Q02509 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
OC90Q02509 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
OC90Q02509 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
OC90Q02509 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
OC90Q02509 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
OC90Q02509 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
OC90Q02509 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
OC90Q02509 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
OC90Q02509 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC18.83■□□□□ 0.61
OC90Q02509 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
OC90Q02509 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
OC90Q02509 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
OC90Q02509 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
OC90Q02509 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
OC90Q02509 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
OC90Q02509 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
OC90Q02509 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
OC90Q02509 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
OC90Q02509 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
OC90Q02509 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
OC90Q02509 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
OC90Q02509 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
OC90Q02509 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
OC90Q02509 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
OC90Q02509 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
OC90Q02509 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
OC90Q02509 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
OC90Q02509 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
OC90Q02509 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
OC90Q02509 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
OC90Q02509 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
OC90Q02509 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
OC90Q02509 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.2 ms