Protein–RNA interactions for Protein: Q02318

CYP27A1, Sterol 26-hydroxylase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 531 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP27A1Q02318 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CYP27A1Q02318 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CYP27A1Q02318 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CYP27A1Q02318 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CYP27A1Q02318 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CYP27A1Q02318 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CYP27A1Q02318 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CYP27A1Q02318 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CYP27A1Q02318 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CYP27A1Q02318 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CYP27A1Q02318 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CYP27A1Q02318 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CYP27A1Q02318 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CYP27A1Q02318 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CYP27A1Q02318 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CYP27A1Q02318 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CYP27A1Q02318 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CYP27A1Q02318 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CYP27A1Q02318 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CYP27A1Q02318 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CYP27A1Q02318 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CYP27A1Q02318 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CYP27A1Q02318 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CYP27A1Q02318 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CYP27A1Q02318 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CYP27A1Q02318 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CYP27A1Q02318 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CYP27A1Q02318 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CYP27A1Q02318 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CYP27A1Q02318 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CYP27A1Q02318 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CYP27A1Q02318 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CYP27A1Q02318 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CYP27A1Q02318 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CYP27A1Q02318 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CYP27A1Q02318 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CYP27A1Q02318 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CYP27A1Q02318 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CYP27A1Q02318 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CYP27A1Q02318 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CYP27A1Q02318 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CYP27A1Q02318 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CYP27A1Q02318 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CYP27A1Q02318 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CYP27A1Q02318 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CYP27A1Q02318 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CYP27A1Q02318 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CYP27A1Q02318 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CYP27A1Q02318 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CYP27A1Q02318 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CYP27A1Q02318 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CYP27A1Q02318 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CYP27A1Q02318 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CYP27A1Q02318 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CYP27A1Q02318 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CYP27A1Q02318 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CYP27A1Q02318 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CYP27A1Q02318 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CYP27A1Q02318 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CYP27A1Q02318 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CYP27A1Q02318 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CYP27A1Q02318 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CYP27A1Q02318 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CYP27A1Q02318 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CYP27A1Q02318 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CYP27A1Q02318 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CYP27A1Q02318 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CYP27A1Q02318 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CYP27A1Q02318 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CYP27A1Q02318 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CYP27A1Q02318 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CYP27A1Q02318 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CYP27A1Q02318 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CYP27A1Q02318 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CYP27A1Q02318 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CYP27A1Q02318 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CYP27A1Q02318 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CYP27A1Q02318 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CYP27A1Q02318 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CYP27A1Q02318 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CYP27A1Q02318 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CYP27A1Q02318 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CYP27A1Q02318 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CYP27A1Q02318 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CYP27A1Q02318 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CYP27A1Q02318 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CYP27A1Q02318 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CYP27A1Q02318 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CYP27A1Q02318 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CYP27A1Q02318 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CYP27A1Q02318 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CYP27A1Q02318 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CYP27A1Q02318 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CYP27A1Q02318 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CYP27A1Q02318 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CYP27A1Q02318 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CYP27A1Q02318 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CYP27A1Q02318 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CYP27A1Q02318 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CYP27A1Q02318 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms