Protein–RNA interactions for Protein: Q01831

XPC, DNA repair protein complementing XP-C cells, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 940 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XPCQ01831 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
XPCQ01831 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
XPCQ01831 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
XPCQ01831 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
XPCQ01831 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
XPCQ01831 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
XPCQ01831 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
XPCQ01831 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
XPCQ01831 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
XPCQ01831 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
XPCQ01831 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
XPCQ01831 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
XPCQ01831 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
XPCQ01831 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
XPCQ01831 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
XPCQ01831 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
XPCQ01831 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
XPCQ01831 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
XPCQ01831 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
XPCQ01831 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
XPCQ01831 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
XPCQ01831 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC27.86■■■□□ 2.05
XPCQ01831 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
XPCQ01831 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
XPCQ01831 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
XPCQ01831 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
XPCQ01831 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
XPCQ01831 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
XPCQ01831 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
XPCQ01831 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
XPCQ01831 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
XPCQ01831 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
XPCQ01831 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
XPCQ01831 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
XPCQ01831 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
XPCQ01831 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
XPCQ01831 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
XPCQ01831 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
XPCQ01831 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
XPCQ01831 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
XPCQ01831 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
XPCQ01831 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
XPCQ01831 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
XPCQ01831 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
XPCQ01831 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
XPCQ01831 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
XPCQ01831 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
XPCQ01831 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
XPCQ01831 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC27.84■■■□□ 2.05
XPCQ01831 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
XPCQ01831 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC27.84■■■□□ 2.05
XPCQ01831 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
XPCQ01831 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
XPCQ01831 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
XPCQ01831 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
XPCQ01831 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
XPCQ01831 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
XPCQ01831 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
XPCQ01831 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
XPCQ01831 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
XPCQ01831 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
XPCQ01831 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
XPCQ01831 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
XPCQ01831 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
XPCQ01831 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
XPCQ01831 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
XPCQ01831 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
XPCQ01831 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
XPCQ01831 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
XPCQ01831 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
XPCQ01831 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
XPCQ01831 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
XPCQ01831 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
XPCQ01831 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
XPCQ01831 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
XPCQ01831 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
XPCQ01831 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
XPCQ01831 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
XPCQ01831 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
XPCQ01831 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
XPCQ01831 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
XPCQ01831 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
XPCQ01831 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
XPCQ01831 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
XPCQ01831 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
XPCQ01831 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC27.82■■■□□ 2.04
XPCQ01831 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
XPCQ01831 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
XPCQ01831 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
XPCQ01831 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
XPCQ01831 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
XPCQ01831 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
XPCQ01831 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
XPCQ01831 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
XPCQ01831 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC27.81■■■□□ 2.04
XPCQ01831 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
XPCQ01831 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
XPCQ01831 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
XPCQ01831 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
XPCQ01831 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms