Protein–RNA interactions for Protein: Q01780

EXOSC10, Exosome component 10, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 885 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC10Q01780 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
EXOSC10Q01780 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
EXOSC10Q01780 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
EXOSC10Q01780 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
EXOSC10Q01780 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
EXOSC10Q01780 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
EXOSC10Q01780 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
EXOSC10Q01780 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
EXOSC10Q01780 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
EXOSC10Q01780 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
EXOSC10Q01780 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
EXOSC10Q01780 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
EXOSC10Q01780 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
EXOSC10Q01780 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
EXOSC10Q01780 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
EXOSC10Q01780 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
EXOSC10Q01780 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
EXOSC10Q01780 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
EXOSC10Q01780 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
EXOSC10Q01780 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
EXOSC10Q01780 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
EXOSC10Q01780 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
EXOSC10Q01780 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
EXOSC10Q01780 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
EXOSC10Q01780 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
EXOSC10Q01780 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
EXOSC10Q01780 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
EXOSC10Q01780 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC23.89■■□□□ 1.41
EXOSC10Q01780 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
EXOSC10Q01780 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
EXOSC10Q01780 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
EXOSC10Q01780 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
EXOSC10Q01780 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
EXOSC10Q01780 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
EXOSC10Q01780 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
EXOSC10Q01780 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
EXOSC10Q01780 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
EXOSC10Q01780 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
EXOSC10Q01780 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
EXOSC10Q01780 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
EXOSC10Q01780 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
EXOSC10Q01780 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
EXOSC10Q01780 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
EXOSC10Q01780 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
EXOSC10Q01780 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
EXOSC10Q01780 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
EXOSC10Q01780 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
EXOSC10Q01780 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
EXOSC10Q01780 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
EXOSC10Q01780 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
EXOSC10Q01780 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
EXOSC10Q01780 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
EXOSC10Q01780 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
EXOSC10Q01780 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
EXOSC10Q01780 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
EXOSC10Q01780 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
EXOSC10Q01780 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
EXOSC10Q01780 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
EXOSC10Q01780 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
EXOSC10Q01780 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
EXOSC10Q01780 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
EXOSC10Q01780 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
EXOSC10Q01780 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
EXOSC10Q01780 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
EXOSC10Q01780 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
EXOSC10Q01780 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
EXOSC10Q01780 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
EXOSC10Q01780 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
EXOSC10Q01780 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
EXOSC10Q01780 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
EXOSC10Q01780 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
EXOSC10Q01780 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
EXOSC10Q01780 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
EXOSC10Q01780 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
EXOSC10Q01780 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
EXOSC10Q01780 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
EXOSC10Q01780 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
EXOSC10Q01780 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
EXOSC10Q01780 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
EXOSC10Q01780 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
EXOSC10Q01780 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
EXOSC10Q01780 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
EXOSC10Q01780 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
EXOSC10Q01780 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
EXOSC10Q01780 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
EXOSC10Q01780 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
EXOSC10Q01780 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
EXOSC10Q01780 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
EXOSC10Q01780 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
EXOSC10Q01780 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
EXOSC10Q01780 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
EXOSC10Q01780 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
EXOSC10Q01780 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
EXOSC10Q01780 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
EXOSC10Q01780 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
EXOSC10Q01780 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
EXOSC10Q01780 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
EXOSC10Q01780 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
EXOSC10Q01780 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
EXOSC10Q01780 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.6 ms