Protein–RNA interactions for Protein: Q01543

FLI1, Friend leukemia integration 1 transcription factor, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 452 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FLI1Q01543 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FLI1Q01543 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FLI1Q01543 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FLI1Q01543 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
FLI1Q01543 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FLI1Q01543 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FLI1Q01543 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FLI1Q01543 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FLI1Q01543 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FLI1Q01543 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FLI1Q01543 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FLI1Q01543 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FLI1Q01543 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FLI1Q01543 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FLI1Q01543 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FLI1Q01543 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FLI1Q01543 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FLI1Q01543 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
FLI1Q01543 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FLI1Q01543 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FLI1Q01543 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
FLI1Q01543 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FLI1Q01543 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
FLI1Q01543 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FLI1Q01543 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FLI1Q01543 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FLI1Q01543 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
FLI1Q01543 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FLI1Q01543 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FLI1Q01543 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FLI1Q01543 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FLI1Q01543 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FLI1Q01543 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FLI1Q01543 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FLI1Q01543 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FLI1Q01543 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FLI1Q01543 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FLI1Q01543 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FLI1Q01543 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FLI1Q01543 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
FLI1Q01543 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FLI1Q01543 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FLI1Q01543 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FLI1Q01543 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FLI1Q01543 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
FLI1Q01543 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FLI1Q01543 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FLI1Q01543 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
FLI1Q01543 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FLI1Q01543 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FLI1Q01543 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FLI1Q01543 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
FLI1Q01543 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FLI1Q01543 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FLI1Q01543 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FLI1Q01543 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FLI1Q01543 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
FLI1Q01543 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FLI1Q01543 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FLI1Q01543 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FLI1Q01543 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FLI1Q01543 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FLI1Q01543 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FLI1Q01543 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FLI1Q01543 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
FLI1Q01543 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FLI1Q01543 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
FLI1Q01543 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FLI1Q01543 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
FLI1Q01543 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FLI1Q01543 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
FLI1Q01543 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FLI1Q01543 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FLI1Q01543 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
FLI1Q01543 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
FLI1Q01543 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
FLI1Q01543 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
FLI1Q01543 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
FLI1Q01543 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
FLI1Q01543 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
FLI1Q01543 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
FLI1Q01543 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
FLI1Q01543 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
FLI1Q01543 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
FLI1Q01543 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
FLI1Q01543 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
FLI1Q01543 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
FLI1Q01543 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
FLI1Q01543 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
FLI1Q01543 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
FLI1Q01543 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
FLI1Q01543 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
FLI1Q01543 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
FLI1Q01543 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
FLI1Q01543 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
FLI1Q01543 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
FLI1Q01543 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
FLI1Q01543 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
FLI1Q01543 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
FLI1Q01543 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms