Protein–RNA interactions for Protein: Q00059

TFAM, Transcription factor A, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFAMQ00059 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TFAMQ00059 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TFAMQ00059 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TFAMQ00059 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TFAMQ00059 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TFAMQ00059 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TFAMQ00059 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TFAMQ00059 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TFAMQ00059 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TFAMQ00059 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TFAMQ00059 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TFAMQ00059 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TFAMQ00059 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TFAMQ00059 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TFAMQ00059 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TFAMQ00059 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TFAMQ00059 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TFAMQ00059 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TFAMQ00059 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TFAMQ00059 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TFAMQ00059 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TFAMQ00059 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TFAMQ00059 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TFAMQ00059 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TFAMQ00059 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TFAMQ00059 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TFAMQ00059 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TFAMQ00059 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TFAMQ00059 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TFAMQ00059 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TFAMQ00059 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TFAMQ00059 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TFAMQ00059 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TFAMQ00059 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TFAMQ00059 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TFAMQ00059 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TFAMQ00059 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
TFAMQ00059 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TFAMQ00059 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TFAMQ00059 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TFAMQ00059 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TFAMQ00059 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TFAMQ00059 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TFAMQ00059 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TFAMQ00059 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TFAMQ00059 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TFAMQ00059 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TFAMQ00059 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TFAMQ00059 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
TFAMQ00059 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
TFAMQ00059 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TFAMQ00059 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TFAMQ00059 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TFAMQ00059 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TFAMQ00059 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TFAMQ00059 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TFAMQ00059 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TFAMQ00059 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TFAMQ00059 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TFAMQ00059 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TFAMQ00059 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TFAMQ00059 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TFAMQ00059 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TFAMQ00059 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TFAMQ00059 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TFAMQ00059 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TFAMQ00059 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TFAMQ00059 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TFAMQ00059 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TFAMQ00059 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TFAMQ00059 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TFAMQ00059 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TFAMQ00059 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TFAMQ00059 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TFAMQ00059 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TFAMQ00059 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TFAMQ00059 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TFAMQ00059 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TFAMQ00059 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TFAMQ00059 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TFAMQ00059 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TFAMQ00059 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TFAMQ00059 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TFAMQ00059 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
TFAMQ00059 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TFAMQ00059 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TFAMQ00059 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TFAMQ00059 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TFAMQ00059 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TFAMQ00059 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TFAMQ00059 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TFAMQ00059 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TFAMQ00059 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TFAMQ00059 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TFAMQ00059 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TFAMQ00059 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TFAMQ00059 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TFAMQ00059 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TFAMQ00059 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TFAMQ00059 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.7 ms