Protein–RNA interactions for Protein: P78333

GPC5, Glypican-5, humanhuman

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Length 572 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC5P78333 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GPC5P78333 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GPC5P78333 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GPC5P78333 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GPC5P78333 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GPC5P78333 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GPC5P78333 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GPC5P78333 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GPC5P78333 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GPC5P78333 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
GPC5P78333 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
GPC5P78333 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GPC5P78333 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
GPC5P78333 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
GPC5P78333 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GPC5P78333 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
GPC5P78333 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GPC5P78333 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GPC5P78333 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
GPC5P78333 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
GPC5P78333 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GPC5P78333 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
GPC5P78333 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GPC5P78333 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
GPC5P78333 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
GPC5P78333 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
GPC5P78333 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
GPC5P78333 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GPC5P78333 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GPC5P78333 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
GPC5P78333 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GPC5P78333 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GPC5P78333 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
GPC5P78333 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
GPC5P78333 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GPC5P78333 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
GPC5P78333 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GPC5P78333 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
GPC5P78333 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC21.92■■□□□ 1.1
GPC5P78333 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
GPC5P78333 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
GPC5P78333 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
GPC5P78333 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
GPC5P78333 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GPC5P78333 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
GPC5P78333 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GPC5P78333 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
GPC5P78333 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GPC5P78333 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GPC5P78333 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GPC5P78333 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GPC5P78333 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GPC5P78333 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
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GPC5P78333 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC21.91■■□□□ 1.1
GPC5P78333 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GPC5P78333 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GPC5P78333 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
GPC5P78333 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GPC5P78333 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
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GPC5P78333 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
GPC5P78333 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GPC5P78333 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GPC5P78333 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
GPC5P78333 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
GPC5P78333 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GPC5P78333 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
GPC5P78333 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
GPC5P78333 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
GPC5P78333 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GPC5P78333 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
GPC5P78333 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
GPC5P78333 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
GPC5P78333 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
GPC5P78333 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC21.9■■□□□ 1.1
GPC5P78333 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
GPC5P78333 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
GPC5P78333 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
GPC5P78333 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GPC5P78333 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GPC5P78333 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GPC5P78333 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GPC5P78333 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GPC5P78333 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GPC5P78333 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GPC5P78333 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
GPC5P78333 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
GPC5P78333 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
GPC5P78333 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
GPC5P78333 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
GPC5P78333 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
GPC5P78333 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
GPC5P78333 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
GPC5P78333 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
GPC5P78333 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
GPC5P78333 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
GPC5P78333 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
GPC5P78333 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
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