Protein–RNA interactions for Protein: P68871

HBB, Hemoglobin subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HBBP68871 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HBBP68871 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HBBP68871 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HBBP68871 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HBBP68871 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HBBP68871 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HBBP68871 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HBBP68871 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HBBP68871 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HBBP68871 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HBBP68871 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HBBP68871 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HBBP68871 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HBBP68871 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
HBBP68871 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HBBP68871 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HBBP68871 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HBBP68871 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HBBP68871 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HBBP68871 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HBBP68871 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HBBP68871 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
HBBP68871 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HBBP68871 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HBBP68871 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HBBP68871 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HBBP68871 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HBBP68871 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HBBP68871 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HBBP68871 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HBBP68871 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HBBP68871 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HBBP68871 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
HBBP68871 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HBBP68871 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HBBP68871 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HBBP68871 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HBBP68871 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HBBP68871 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HBBP68871 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HBBP68871 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HBBP68871 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HBBP68871 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HBBP68871 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HBBP68871 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HBBP68871 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HBBP68871 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HBBP68871 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HBBP68871 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HBBP68871 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HBBP68871 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HBBP68871 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
HBBP68871 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HBBP68871 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HBBP68871 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HBBP68871 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HBBP68871 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HBBP68871 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HBBP68871 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HBBP68871 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HBBP68871 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HBBP68871 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HBBP68871 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HBBP68871 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HBBP68871 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HBBP68871 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HBBP68871 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HBBP68871 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HBBP68871 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HBBP68871 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HBBP68871 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HBBP68871 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HBBP68871 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HBBP68871 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HBBP68871 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HBBP68871 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HBBP68871 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HBBP68871 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HBBP68871 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HBBP68871 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HBBP68871 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HBBP68871 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HBBP68871 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HBBP68871 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HBBP68871 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HBBP68871 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HBBP68871 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HBBP68871 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HBBP68871 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HBBP68871 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HBBP68871 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HBBP68871 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HBBP68871 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HBBP68871 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HBBP68871 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HBBP68871 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HBBP68871 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HBBP68871 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HBBP68871 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HBBP68871 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms