Protein–RNA interactions for Protein: P68371

TUBB4B, Tubulin beta-4B chain, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB4BP68371 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TUBB4BP68371 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TUBB4BP68371 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TUBB4BP68371 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TUBB4BP68371 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TUBB4BP68371 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TUBB4BP68371 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TUBB4BP68371 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TUBB4BP68371 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TUBB4BP68371 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TUBB4BP68371 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TUBB4BP68371 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TUBB4BP68371 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TUBB4BP68371 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TUBB4BP68371 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TUBB4BP68371 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TUBB4BP68371 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TUBB4BP68371 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TUBB4BP68371 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TUBB4BP68371 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
TUBB4BP68371 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TUBB4BP68371 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TUBB4BP68371 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TUBB4BP68371 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TUBB4BP68371 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TUBB4BP68371 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TUBB4BP68371 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TUBB4BP68371 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TUBB4BP68371 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TUBB4BP68371 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TUBB4BP68371 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
TUBB4BP68371 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TUBB4BP68371 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
TUBB4BP68371 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TUBB4BP68371 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TUBB4BP68371 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TUBB4BP68371 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TUBB4BP68371 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TUBB4BP68371 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TUBB4BP68371 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TUBB4BP68371 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TUBB4BP68371 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TUBB4BP68371 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TUBB4BP68371 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TUBB4BP68371 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TUBB4BP68371 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TUBB4BP68371 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TUBB4BP68371 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TUBB4BP68371 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TUBB4BP68371 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TUBB4BP68371 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
TUBB4BP68371 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TUBB4BP68371 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TUBB4BP68371 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TUBB4BP68371 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TUBB4BP68371 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TUBB4BP68371 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TUBB4BP68371 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
TUBB4BP68371 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TUBB4BP68371 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TUBB4BP68371 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TUBB4BP68371 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TUBB4BP68371 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TUBB4BP68371 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TUBB4BP68371 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TUBB4BP68371 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TUBB4BP68371 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TUBB4BP68371 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TUBB4BP68371 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
TUBB4BP68371 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TUBB4BP68371 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TUBB4BP68371 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TUBB4BP68371 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TUBB4BP68371 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TUBB4BP68371 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TUBB4BP68371 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TUBB4BP68371 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TUBB4BP68371 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TUBB4BP68371 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TUBB4BP68371 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TUBB4BP68371 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TUBB4BP68371 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
TUBB4BP68371 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TUBB4BP68371 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TUBB4BP68371 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TUBB4BP68371 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TUBB4BP68371 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TUBB4BP68371 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TUBB4BP68371 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TUBB4BP68371 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TUBB4BP68371 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TUBB4BP68371 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TUBB4BP68371 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TUBB4BP68371 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
TUBB4BP68371 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TUBB4BP68371 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TUBB4BP68371 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TUBB4BP68371 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TUBB4BP68371 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TUBB4BP68371 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms