Protein–RNA interactions for Protein: P63165

SUMO1, Small ubiquitin-related modifier 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 101 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUMO1P63165 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SUMO1P63165 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SUMO1P63165 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SUMO1P63165 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
SUMO1P63165 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SUMO1P63165 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SUMO1P63165 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SUMO1P63165 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SUMO1P63165 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SUMO1P63165 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SUMO1P63165 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SUMO1P63165 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SUMO1P63165 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SUMO1P63165 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SUMO1P63165 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SUMO1P63165 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SUMO1P63165 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SUMO1P63165 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SUMO1P63165 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SUMO1P63165 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SUMO1P63165 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
SUMO1P63165 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SUMO1P63165 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SUMO1P63165 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SUMO1P63165 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SUMO1P63165 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SUMO1P63165 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SUMO1P63165 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SUMO1P63165 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SUMO1P63165 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SUMO1P63165 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SUMO1P63165 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SUMO1P63165 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SUMO1P63165 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SUMO1P63165 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SUMO1P63165 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SUMO1P63165 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SUMO1P63165 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SUMO1P63165 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SUMO1P63165 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SUMO1P63165 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SUMO1P63165 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SUMO1P63165 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SUMO1P63165 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SUMO1P63165 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SUMO1P63165 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SUMO1P63165 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SUMO1P63165 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SUMO1P63165 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SUMO1P63165 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SUMO1P63165 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SUMO1P63165 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SUMO1P63165 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SUMO1P63165 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SUMO1P63165 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SUMO1P63165 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SUMO1P63165 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SUMO1P63165 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SUMO1P63165 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SUMO1P63165 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SUMO1P63165 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SUMO1P63165 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SUMO1P63165 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SUMO1P63165 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SUMO1P63165 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SUMO1P63165 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SUMO1P63165 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SUMO1P63165 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SUMO1P63165 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SUMO1P63165 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SUMO1P63165 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SUMO1P63165 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SUMO1P63165 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SUMO1P63165 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SUMO1P63165 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SUMO1P63165 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SUMO1P63165 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SUMO1P63165 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SUMO1P63165 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SUMO1P63165 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SUMO1P63165 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SUMO1P63165 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SUMO1P63165 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SUMO1P63165 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SUMO1P63165 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SUMO1P63165 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SUMO1P63165 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SUMO1P63165 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SUMO1P63165 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SUMO1P63165 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SUMO1P63165 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SUMO1P63165 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SUMO1P63165 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SUMO1P63165 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SUMO1P63165 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SUMO1P63165 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SUMO1P63165 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SUMO1P63165 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SUMO1P63165 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SUMO1P63165 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms