Protein–RNA interactions for Protein: P62829

RPL23, 60S ribosomal protein L23, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL23P62829 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
RPL23P62829 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RPL23P62829 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RPL23P62829 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RPL23P62829 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RPL23P62829 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RPL23P62829 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RPL23P62829 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
RPL23P62829 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RPL23P62829 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RPL23P62829 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RPL23P62829 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RPL23P62829 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RPL23P62829 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RPL23P62829 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RPL23P62829 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RPL23P62829 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RPL23P62829 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RPL23P62829 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RPL23P62829 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RPL23P62829 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
RPL23P62829 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RPL23P62829 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RPL23P62829 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
RPL23P62829 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RPL23P62829 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RPL23P62829 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RPL23P62829 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RPL23P62829 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RPL23P62829 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RPL23P62829 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
RPL23P62829 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RPL23P62829 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RPL23P62829 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RPL23P62829 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RPL23P62829 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RPL23P62829 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RPL23P62829 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
RPL23P62829 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RPL23P62829 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RPL23P62829 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RPL23P62829 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RPL23P62829 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RPL23P62829 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RPL23P62829 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RPL23P62829 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
RPL23P62829 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RPL23P62829 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RPL23P62829 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RPL23P62829 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RPL23P62829 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RPL23P62829 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RPL23P62829 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RPL23P62829 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RPL23P62829 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RPL23P62829 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RPL23P62829 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RPL23P62829 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RPL23P62829 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RPL23P62829 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
RPL23P62829 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
RPL23P62829 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
RPL23P62829 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RPL23P62829 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RPL23P62829 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RPL23P62829 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RPL23P62829 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RPL23P62829 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RPL23P62829 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RPL23P62829 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RPL23P62829 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RPL23P62829 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RPL23P62829 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RPL23P62829 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RPL23P62829 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RPL23P62829 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RPL23P62829 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RPL23P62829 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RPL23P62829 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RPL23P62829 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RPL23P62829 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RPL23P62829 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RPL23P62829 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RPL23P62829 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RPL23P62829 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RPL23P62829 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RPL23P62829 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RPL23P62829 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RPL23P62829 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RPL23P62829 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RPL23P62829 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RPL23P62829 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
RPL23P62829 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RPL23P62829 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RPL23P62829 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RPL23P62829 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RPL23P62829 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RPL23P62829 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RPL23P62829 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RPL23P62829 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms