Protein–RNA interactions for Protein: P62273

RPS29, 40S ribosomal protein S29, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 56 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS29P62273 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
RPS29P62273 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
RPS29P62273 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
RPS29P62273 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
RPS29P62273 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
RPS29P62273 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
RPS29P62273 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
RPS29P62273 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
RPS29P62273 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
RPS29P62273 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
RPS29P62273 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
RPS29P62273 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
RPS29P62273 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
RPS29P62273 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
RPS29P62273 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
RPS29P62273 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
RPS29P62273 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
RPS29P62273 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC11.57□□□□□ -0.56
RPS29P62273 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
RPS29P62273 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
RPS29P62273 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC11.57□□□□□ -0.56
RPS29P62273 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
RPS29P62273 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
RPS29P62273 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
RPS29P62273 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
RPS29P62273 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC11.57□□□□□ -0.56
RPS29P62273 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
RPS29P62273 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
RPS29P62273 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
RPS29P62273 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
RPS29P62273 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
RPS29P62273 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
RPS29P62273 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
RPS29P62273 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
RPS29P62273 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
RPS29P62273 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
RPS29P62273 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
RPS29P62273 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
RPS29P62273 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
RPS29P62273 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
RPS29P62273 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
RPS29P62273 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
RPS29P62273 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
RPS29P62273 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
RPS29P62273 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
RPS29P62273 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
RPS29P62273 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
RPS29P62273 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
RPS29P62273 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
RPS29P62273 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
RPS29P62273 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
RPS29P62273 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
RPS29P62273 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
RPS29P62273 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
RPS29P62273 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
RPS29P62273 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
RPS29P62273 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
RPS29P62273 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
RPS29P62273 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
RPS29P62273 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
RPS29P62273 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
RPS29P62273 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
RPS29P62273 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
RPS29P62273 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
RPS29P62273 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
RPS29P62273 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
RPS29P62273 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
RPS29P62273 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
RPS29P62273 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
RPS29P62273 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
RPS29P62273 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
RPS29P62273 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
RPS29P62273 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC11.56□□□□□ -0.56
RPS29P62273 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
RPS29P62273 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
RPS29P62273 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
RPS29P62273 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
RPS29P62273 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
RPS29P62273 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
RPS29P62273 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
RPS29P62273 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
RPS29P62273 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
RPS29P62273 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
RPS29P62273 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
RPS29P62273 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
RPS29P62273 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
RPS29P62273 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
RPS29P62273 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC11.55□□□□□ -0.56
RPS29P62273 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
RPS29P62273 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
RPS29P62273 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
RPS29P62273 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
RPS29P62273 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
RPS29P62273 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
RPS29P62273 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
RPS29P62273 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
RPS29P62273 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
RPS29P62273 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
RPS29P62273 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
RPS29P62273 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC11.55□□□□□ -0.56
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