Protein–RNA interactions for Protein: P59074

CHMP4BP1, Putative charged multivesicular body protein 4B-like protein CHMP4BP1, humanhuman

Predictions only

Length 171 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP4BP1P59074 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CHMP4BP1P59074 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CHMP4BP1P59074 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
CHMP4BP1P59074 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CHMP4BP1P59074 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CHMP4BP1P59074 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CHMP4BP1P59074 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CHMP4BP1P59074 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CHMP4BP1P59074 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CHMP4BP1P59074 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CHMP4BP1P59074 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CHMP4BP1P59074 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CHMP4BP1P59074 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CHMP4BP1P59074 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CHMP4BP1P59074 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
CHMP4BP1P59074 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
CHMP4BP1P59074 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CHMP4BP1P59074 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CHMP4BP1P59074 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CHMP4BP1P59074 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CHMP4BP1P59074 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CHMP4BP1P59074 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CHMP4BP1P59074 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CHMP4BP1P59074 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CHMP4BP1P59074 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CHMP4BP1P59074 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CHMP4BP1P59074 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CHMP4BP1P59074 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CHMP4BP1P59074 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CHMP4BP1P59074 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CHMP4BP1P59074 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CHMP4BP1P59074 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CHMP4BP1P59074 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CHMP4BP1P59074 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CHMP4BP1P59074 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
CHMP4BP1P59074 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CHMP4BP1P59074 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CHMP4BP1P59074 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CHMP4BP1P59074 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CHMP4BP1P59074 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CHMP4BP1P59074 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CHMP4BP1P59074 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CHMP4BP1P59074 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CHMP4BP1P59074 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CHMP4BP1P59074 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CHMP4BP1P59074 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CHMP4BP1P59074 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CHMP4BP1P59074 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CHMP4BP1P59074 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CHMP4BP1P59074 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CHMP4BP1P59074 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CHMP4BP1P59074 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
CHMP4BP1P59074 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CHMP4BP1P59074 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CHMP4BP1P59074 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CHMP4BP1P59074 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CHMP4BP1P59074 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CHMP4BP1P59074 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CHMP4BP1P59074 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CHMP4BP1P59074 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CHMP4BP1P59074 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CHMP4BP1P59074 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CHMP4BP1P59074 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CHMP4BP1P59074 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CHMP4BP1P59074 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CHMP4BP1P59074 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CHMP4BP1P59074 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CHMP4BP1P59074 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CHMP4BP1P59074 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CHMP4BP1P59074 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CHMP4BP1P59074 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CHMP4BP1P59074 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CHMP4BP1P59074 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CHMP4BP1P59074 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
CHMP4BP1P59074 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CHMP4BP1P59074 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CHMP4BP1P59074 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CHMP4BP1P59074 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CHMP4BP1P59074 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CHMP4BP1P59074 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CHMP4BP1P59074 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CHMP4BP1P59074 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CHMP4BP1P59074 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CHMP4BP1P59074 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CHMP4BP1P59074 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CHMP4BP1P59074 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CHMP4BP1P59074 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CHMP4BP1P59074 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CHMP4BP1P59074 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
CHMP4BP1P59074 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CHMP4BP1P59074 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
CHMP4BP1P59074 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CHMP4BP1P59074 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CHMP4BP1P59074 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CHMP4BP1P59074 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CHMP4BP1P59074 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CHMP4BP1P59074 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CHMP4BP1P59074 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CHMP4BP1P59074 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CHMP4BP1P59074 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.9 ms