Protein–RNA interactions for Protein: P58872

RHBDL3, Rhomboid-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHBDL3P58872 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RHBDL3P58872 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RHBDL3P58872 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RHBDL3P58872 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RHBDL3P58872 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RHBDL3P58872 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RHBDL3P58872 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
RHBDL3P58872 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RHBDL3P58872 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RHBDL3P58872 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RHBDL3P58872 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RHBDL3P58872 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RHBDL3P58872 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RHBDL3P58872 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RHBDL3P58872 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RHBDL3P58872 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RHBDL3P58872 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RHBDL3P58872 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RHBDL3P58872 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RHBDL3P58872 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RHBDL3P58872 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RHBDL3P58872 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RHBDL3P58872 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
RHBDL3P58872 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RHBDL3P58872 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RHBDL3P58872 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RHBDL3P58872 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RHBDL3P58872 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
RHBDL3P58872 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RHBDL3P58872 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RHBDL3P58872 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RHBDL3P58872 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RHBDL3P58872 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RHBDL3P58872 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RHBDL3P58872 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RHBDL3P58872 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RHBDL3P58872 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RHBDL3P58872 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RHBDL3P58872 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RHBDL3P58872 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RHBDL3P58872 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RHBDL3P58872 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RHBDL3P58872 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RHBDL3P58872 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RHBDL3P58872 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RHBDL3P58872 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
RHBDL3P58872 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RHBDL3P58872 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RHBDL3P58872 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RHBDL3P58872 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RHBDL3P58872 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RHBDL3P58872 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RHBDL3P58872 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RHBDL3P58872 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RHBDL3P58872 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RHBDL3P58872 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RHBDL3P58872 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
RHBDL3P58872 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RHBDL3P58872 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RHBDL3P58872 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
RHBDL3P58872 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RHBDL3P58872 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RHBDL3P58872 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RHBDL3P58872 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RHBDL3P58872 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RHBDL3P58872 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RHBDL3P58872 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RHBDL3P58872 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
RHBDL3P58872 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RHBDL3P58872 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RHBDL3P58872 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RHBDL3P58872 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RHBDL3P58872 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RHBDL3P58872 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RHBDL3P58872 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RHBDL3P58872 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RHBDL3P58872 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RHBDL3P58872 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RHBDL3P58872 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RHBDL3P58872 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RHBDL3P58872 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RHBDL3P58872 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RHBDL3P58872 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RHBDL3P58872 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RHBDL3P58872 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RHBDL3P58872 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RHBDL3P58872 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RHBDL3P58872 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RHBDL3P58872 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.46
RHBDL3P58872 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
RHBDL3P58872 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
RHBDL3P58872 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RHBDL3P58872 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RHBDL3P58872 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
RHBDL3P58872 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RHBDL3P58872 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RHBDL3P58872 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RHBDL3P58872 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RHBDL3P58872 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RHBDL3P58872 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms