Protein–RNA interactions for Protein: P56746

CLDN15, Claudin-15, humanhuman

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN15P56746 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CLDN15P56746 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CLDN15P56746 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CLDN15P56746 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CLDN15P56746 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CLDN15P56746 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CLDN15P56746 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CLDN15P56746 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CLDN15P56746 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CLDN15P56746 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CLDN15P56746 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CLDN15P56746 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CLDN15P56746 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CLDN15P56746 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CLDN15P56746 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CLDN15P56746 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CLDN15P56746 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CLDN15P56746 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CLDN15P56746 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CLDN15P56746 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CLDN15P56746 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CLDN15P56746 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CLDN15P56746 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CLDN15P56746 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CLDN15P56746 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CLDN15P56746 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CLDN15P56746 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CLDN15P56746 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CLDN15P56746 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CLDN15P56746 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CLDN15P56746 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CLDN15P56746 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CLDN15P56746 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CLDN15P56746 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CLDN15P56746 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CLDN15P56746 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CLDN15P56746 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CLDN15P56746 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CLDN15P56746 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CLDN15P56746 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CLDN15P56746 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CLDN15P56746 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CLDN15P56746 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLDN15P56746 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLDN15P56746 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLDN15P56746 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLDN15P56746 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLDN15P56746 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLDN15P56746 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLDN15P56746 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLDN15P56746 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLDN15P56746 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLDN15P56746 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLDN15P56746 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLDN15P56746 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLDN15P56746 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLDN15P56746 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLDN15P56746 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLDN15P56746 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLDN15P56746 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLDN15P56746 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLDN15P56746 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLDN15P56746 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLDN15P56746 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLDN15P56746 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLDN15P56746 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLDN15P56746 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLDN15P56746 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLDN15P56746 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLDN15P56746 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLDN15P56746 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLDN15P56746 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLDN15P56746 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLDN15P56746 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLDN15P56746 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLDN15P56746 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLDN15P56746 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLDN15P56746 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLDN15P56746 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLDN15P56746 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CLDN15P56746 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CLDN15P56746 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CLDN15P56746 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CLDN15P56746 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CLDN15P56746 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CLDN15P56746 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CLDN15P56746 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CLDN15P56746 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CLDN15P56746 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CLDN15P56746 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CLDN15P56746 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CLDN15P56746 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CLDN15P56746 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CLDN15P56746 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CLDN15P56746 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CLDN15P56746 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CLDN15P56746 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CLDN15P56746 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CLDN15P56746 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CLDN15P56746 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.8 ms