Protein–RNA interactions for Protein: P56182

RRP1, Ribosomal RNA processing protein 1 homolog A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRP1P56182 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
RRP1P56182 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
RRP1P56182 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
RRP1P56182 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
RRP1P56182 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
RRP1P56182 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
RRP1P56182 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
RRP1P56182 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
RRP1P56182 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
RRP1P56182 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
RRP1P56182 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
RRP1P56182 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
RRP1P56182 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
RRP1P56182 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
RRP1P56182 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
RRP1P56182 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
RRP1P56182 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
RRP1P56182 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
RRP1P56182 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
RRP1P56182 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
RRP1P56182 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
RRP1P56182 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
RRP1P56182 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
RRP1P56182 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
RRP1P56182 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
RRP1P56182 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
RRP1P56182 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
RRP1P56182 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
RRP1P56182 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
RRP1P56182 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
RRP1P56182 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
RRP1P56182 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
RRP1P56182 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
RRP1P56182 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
RRP1P56182 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
RRP1P56182 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
RRP1P56182 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
RRP1P56182 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
RRP1P56182 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
RRP1P56182 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
RRP1P56182 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
RRP1P56182 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
RRP1P56182 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
RRP1P56182 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
RRP1P56182 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
RRP1P56182 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
RRP1P56182 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
RRP1P56182 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
RRP1P56182 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
RRP1P56182 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
RRP1P56182 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
RRP1P56182 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
RRP1P56182 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
RRP1P56182 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
RRP1P56182 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
RRP1P56182 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
RRP1P56182 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
RRP1P56182 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
RRP1P56182 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
RRP1P56182 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
RRP1P56182 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
RRP1P56182 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
RRP1P56182 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
RRP1P56182 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
RRP1P56182 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
RRP1P56182 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
RRP1P56182 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
RRP1P56182 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
RRP1P56182 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
RRP1P56182 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
RRP1P56182 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
RRP1P56182 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
RRP1P56182 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
RRP1P56182 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
RRP1P56182 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
RRP1P56182 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
RRP1P56182 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
RRP1P56182 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
RRP1P56182 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
RRP1P56182 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
RRP1P56182 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
RRP1P56182 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
RRP1P56182 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
RRP1P56182 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
RRP1P56182 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
RRP1P56182 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
RRP1P56182 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
RRP1P56182 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
RRP1P56182 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
RRP1P56182 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
RRP1P56182 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
RRP1P56182 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
RRP1P56182 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
RRP1P56182 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
RRP1P56182 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
RRP1P56182 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
RRP1P56182 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
RRP1P56182 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
RRP1P56182 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
RRP1P56182 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms