Protein–RNA interactions for Protein: P54707

ATP12A, Potassium-transporting ATPase alpha chain 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,039 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP12AP54707 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ATP12AP54707 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ATP12AP54707 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ATP12AP54707 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ATP12AP54707 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
ATP12AP54707 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ATP12AP54707 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ATP12AP54707 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ATP12AP54707 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ATP12AP54707 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ATP12AP54707 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ATP12AP54707 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ATP12AP54707 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
ATP12AP54707 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ATP12AP54707 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
ATP12AP54707 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
ATP12AP54707 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
ATP12AP54707 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ATP12AP54707 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ATP12AP54707 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ATP12AP54707 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ATP12AP54707 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ATP12AP54707 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ATP12AP54707 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ATP12AP54707 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ATP12AP54707 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ATP12AP54707 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ATP12AP54707 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
ATP12AP54707 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ATP12AP54707 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ATP12AP54707 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ATP12AP54707 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ATP12AP54707 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ATP12AP54707 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ATP12AP54707 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ATP12AP54707 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ATP12AP54707 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ATP12AP54707 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ATP12AP54707 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
ATP12AP54707 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ATP12AP54707 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
ATP12AP54707 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ATP12AP54707 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ATP12AP54707 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ATP12AP54707 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ATP12AP54707 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ATP12AP54707 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ATP12AP54707 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ATP12AP54707 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ATP12AP54707 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ATP12AP54707 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ATP12AP54707 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ATP12AP54707 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ATP12AP54707 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ATP12AP54707 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
ATP12AP54707 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ATP12AP54707 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ATP12AP54707 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
ATP12AP54707 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ATP12AP54707 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ATP12AP54707 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ATP12AP54707 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ATP12AP54707 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ATP12AP54707 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ATP12AP54707 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ATP12AP54707 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ATP12AP54707 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ATP12AP54707 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ATP12AP54707 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ATP12AP54707 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ATP12AP54707 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ATP12AP54707 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ATP12AP54707 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ATP12AP54707 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ATP12AP54707 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
ATP12AP54707 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ATP12AP54707 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
ATP12AP54707 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ATP12AP54707 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ATP12AP54707 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ATP12AP54707 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ATP12AP54707 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ATP12AP54707 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ATP12AP54707 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ATP12AP54707 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ATP12AP54707 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ATP12AP54707 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ATP12AP54707 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ATP12AP54707 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ATP12AP54707 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ATP12AP54707 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ATP12AP54707 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ATP12AP54707 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ATP12AP54707 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ATP12AP54707 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ATP12AP54707 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ATP12AP54707 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ATP12AP54707 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ATP12AP54707 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ATP12AP54707 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.7 ms