Protein–RNA interactions for Protein: P54289

CACNA2D1, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA2D1P54289 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CACNA2D1P54289 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CACNA2D1P54289 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CACNA2D1P54289 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CACNA2D1P54289 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CACNA2D1P54289 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CACNA2D1P54289 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CACNA2D1P54289 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CACNA2D1P54289 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
CACNA2D1P54289 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CACNA2D1P54289 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CACNA2D1P54289 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CACNA2D1P54289 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CACNA2D1P54289 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CACNA2D1P54289 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CACNA2D1P54289 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CACNA2D1P54289 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CACNA2D1P54289 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CACNA2D1P54289 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CACNA2D1P54289 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CACNA2D1P54289 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CACNA2D1P54289 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CACNA2D1P54289 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CACNA2D1P54289 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CACNA2D1P54289 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CACNA2D1P54289 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CACNA2D1P54289 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CACNA2D1P54289 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CACNA2D1P54289 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CACNA2D1P54289 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CACNA2D1P54289 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
CACNA2D1P54289 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
CACNA2D1P54289 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CACNA2D1P54289 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CACNA2D1P54289 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CACNA2D1P54289 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CACNA2D1P54289 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CACNA2D1P54289 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CACNA2D1P54289 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CACNA2D1P54289 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CACNA2D1P54289 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CACNA2D1P54289 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CACNA2D1P54289 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CACNA2D1P54289 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CACNA2D1P54289 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CACNA2D1P54289 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CACNA2D1P54289 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CACNA2D1P54289 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CACNA2D1P54289 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CACNA2D1P54289 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CACNA2D1P54289 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CACNA2D1P54289 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CACNA2D1P54289 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CACNA2D1P54289 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CACNA2D1P54289 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CACNA2D1P54289 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CACNA2D1P54289 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CACNA2D1P54289 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CACNA2D1P54289 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CACNA2D1P54289 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CACNA2D1P54289 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CACNA2D1P54289 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CACNA2D1P54289 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CACNA2D1P54289 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
CACNA2D1P54289 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CACNA2D1P54289 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CACNA2D1P54289 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CACNA2D1P54289 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CACNA2D1P54289 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CACNA2D1P54289 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CACNA2D1P54289 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CACNA2D1P54289 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CACNA2D1P54289 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CACNA2D1P54289 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CACNA2D1P54289 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CACNA2D1P54289 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CACNA2D1P54289 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CACNA2D1P54289 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CACNA2D1P54289 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CACNA2D1P54289 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CACNA2D1P54289 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CACNA2D1P54289 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CACNA2D1P54289 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CACNA2D1P54289 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CACNA2D1P54289 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CACNA2D1P54289 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CACNA2D1P54289 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CACNA2D1P54289 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CACNA2D1P54289 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CACNA2D1P54289 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CACNA2D1P54289 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CACNA2D1P54289 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CACNA2D1P54289 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CACNA2D1P54289 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CACNA2D1P54289 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CACNA2D1P54289 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
CACNA2D1P54289 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CACNA2D1P54289 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CACNA2D1P54289 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CACNA2D1P54289 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms