Protein–RNA interactions for Protein: P54108

CRISP3, Cysteine-rich secretory protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 245 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRISP3P54108 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CRISP3P54108 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC19■□□□□ 0.63
CRISP3P54108 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CRISP3P54108 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CRISP3P54108 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CRISP3P54108 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CRISP3P54108 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CRISP3P54108 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CRISP3P54108 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CRISP3P54108 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CRISP3P54108 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CRISP3P54108 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CRISP3P54108 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CRISP3P54108 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CRISP3P54108 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CRISP3P54108 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CRISP3P54108 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CRISP3P54108 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CRISP3P54108 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
CRISP3P54108 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CRISP3P54108 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CRISP3P54108 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CRISP3P54108 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CRISP3P54108 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CRISP3P54108 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CRISP3P54108 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CRISP3P54108 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CRISP3P54108 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CRISP3P54108 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CRISP3P54108 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CRISP3P54108 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CRISP3P54108 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CRISP3P54108 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CRISP3P54108 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CRISP3P54108 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CRISP3P54108 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CRISP3P54108 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CRISP3P54108 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CRISP3P54108 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CRISP3P54108 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CRISP3P54108 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CRISP3P54108 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CRISP3P54108 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CRISP3P54108 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CRISP3P54108 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CRISP3P54108 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
CRISP3P54108 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CRISP3P54108 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CRISP3P54108 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CRISP3P54108 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CRISP3P54108 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CRISP3P54108 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CRISP3P54108 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CRISP3P54108 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CRISP3P54108 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CRISP3P54108 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CRISP3P54108 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CRISP3P54108 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CRISP3P54108 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CRISP3P54108 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CRISP3P54108 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CRISP3P54108 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CRISP3P54108 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CRISP3P54108 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CRISP3P54108 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CRISP3P54108 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CRISP3P54108 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CRISP3P54108 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CRISP3P54108 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CRISP3P54108 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CRISP3P54108 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CRISP3P54108 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CRISP3P54108 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CRISP3P54108 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CRISP3P54108 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CRISP3P54108 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CRISP3P54108 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CRISP3P54108 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CRISP3P54108 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CRISP3P54108 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CRISP3P54108 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CRISP3P54108 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CRISP3P54108 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CRISP3P54108 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CRISP3P54108 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CRISP3P54108 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CRISP3P54108 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CRISP3P54108 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
CRISP3P54108 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CRISP3P54108 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CRISP3P54108 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CRISP3P54108 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CRISP3P54108 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CRISP3P54108 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CRISP3P54108 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CRISP3P54108 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CRISP3P54108 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CRISP3P54108 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CRISP3P54108 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CRISP3P54108 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms