Protein–RNA interactions for Protein: P50549

ETV1, ETS translocation variant 1, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ETV1P50549 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ETV1P50549 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ETV1P50549 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ETV1P50549 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ETV1P50549 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ETV1P50549 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ETV1P50549 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
ETV1P50549 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
ETV1P50549 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
ETV1P50549 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
ETV1P50549 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ETV1P50549 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ETV1P50549 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ETV1P50549 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ETV1P50549 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ETV1P50549 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ETV1P50549 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ETV1P50549 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ETV1P50549 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ETV1P50549 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ETV1P50549 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ETV1P50549 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ETV1P50549 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
ETV1P50549 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ETV1P50549 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ETV1P50549 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ETV1P50549 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ETV1P50549 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ETV1P50549 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ETV1P50549 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ETV1P50549 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ETV1P50549 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ETV1P50549 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ETV1P50549 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ETV1P50549 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ETV1P50549 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ETV1P50549 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ETV1P50549 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ETV1P50549 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ETV1P50549 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
ETV1P50549 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ETV1P50549 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ETV1P50549 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
ETV1P50549 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ETV1P50549 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ETV1P50549 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ETV1P50549 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ETV1P50549 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ETV1P50549 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ETV1P50549 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ETV1P50549 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
ETV1P50549 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ETV1P50549 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ETV1P50549 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ETV1P50549 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ETV1P50549 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ETV1P50549 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ETV1P50549 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ETV1P50549 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ETV1P50549 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ETV1P50549 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ETV1P50549 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ETV1P50549 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ETV1P50549 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ETV1P50549 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ETV1P50549 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
ETV1P50549 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ETV1P50549 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ETV1P50549 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ETV1P50549 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ETV1P50549 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ETV1P50549 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ETV1P50549 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ETV1P50549 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ETV1P50549 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ETV1P50549 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ETV1P50549 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ETV1P50549 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ETV1P50549 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ETV1P50549 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ETV1P50549 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ETV1P50549 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ETV1P50549 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ETV1P50549 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ETV1P50549 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ETV1P50549 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ETV1P50549 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ETV1P50549 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ETV1P50549 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ETV1P50549 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ETV1P50549 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
ETV1P50549 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ETV1P50549 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ETV1P50549 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ETV1P50549 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ETV1P50549 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
ETV1P50549 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ETV1P50549 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ETV1P50549 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ETV1P50549 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms