Protein–RNA interactions for Protein: P49427

CDC34, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 R1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC34P49427 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDC34P49427 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDC34P49427 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDC34P49427 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDC34P49427 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDC34P49427 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDC34P49427 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDC34P49427 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDC34P49427 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDC34P49427 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDC34P49427 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDC34P49427 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDC34P49427 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDC34P49427 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDC34P49427 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDC34P49427 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDC34P49427 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDC34P49427 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDC34P49427 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDC34P49427 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CDC34P49427 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CDC34P49427 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CDC34P49427 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CDC34P49427 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CDC34P49427 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CDC34P49427 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CDC34P49427 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CDC34P49427 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CDC34P49427 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CDC34P49427 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CDC34P49427 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CDC34P49427 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CDC34P49427 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CDC34P49427 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
CDC34P49427 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CDC34P49427 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CDC34P49427 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CDC34P49427 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CDC34P49427 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CDC34P49427 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CDC34P49427 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CDC34P49427 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CDC34P49427 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CDC34P49427 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CDC34P49427 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CDC34P49427 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CDC34P49427 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDC34P49427 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDC34P49427 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDC34P49427 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDC34P49427 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDC34P49427 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDC34P49427 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDC34P49427 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDC34P49427 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDC34P49427 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDC34P49427 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDC34P49427 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDC34P49427 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDC34P49427 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDC34P49427 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDC34P49427 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDC34P49427 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDC34P49427 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDC34P49427 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDC34P49427 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDC34P49427 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDC34P49427 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDC34P49427 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDC34P49427 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDC34P49427 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDC34P49427 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDC34P49427 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDC34P49427 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDC34P49427 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDC34P49427 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDC34P49427 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDC34P49427 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDC34P49427 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDC34P49427 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDC34P49427 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDC34P49427 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDC34P49427 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDC34P49427 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDC34P49427 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDC34P49427 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDC34P49427 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDC34P49427 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDC34P49427 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDC34P49427 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDC34P49427 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDC34P49427 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDC34P49427 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDC34P49427 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDC34P49427 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDC34P49427 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDC34P49427 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDC34P49427 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDC34P49427 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDC34P49427 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms