Protein–RNA interactions for Protein: P49279

SLC11A1, Natural resistance-associated macrophage protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 550 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC11A1P49279 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SLC11A1P49279 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SLC11A1P49279 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SLC11A1P49279 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.07
SLC11A1P49279 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SLC11A1P49279 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
SLC11A1P49279 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SLC11A1P49279 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SLC11A1P49279 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SLC11A1P49279 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SLC11A1P49279 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SLC11A1P49279 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SLC11A1P49279 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SLC11A1P49279 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SLC11A1P49279 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SLC11A1P49279 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SLC11A1P49279 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
SLC11A1P49279 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SLC11A1P49279 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SLC11A1P49279 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SLC11A1P49279 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SLC11A1P49279 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SLC11A1P49279 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SLC11A1P49279 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SLC11A1P49279 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SLC11A1P49279 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SLC11A1P49279 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SLC11A1P49279 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SLC11A1P49279 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SLC11A1P49279 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SLC11A1P49279 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SLC11A1P49279 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SLC11A1P49279 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SLC11A1P49279 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SLC11A1P49279 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SLC11A1P49279 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SLC11A1P49279 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SLC11A1P49279 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SLC11A1P49279 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SLC11A1P49279 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SLC11A1P49279 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
SLC11A1P49279 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SLC11A1P49279 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SLC11A1P49279 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
SLC11A1P49279 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SLC11A1P49279 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SLC11A1P49279 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SLC11A1P49279 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SLC11A1P49279 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SLC11A1P49279 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SLC11A1P49279 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SLC11A1P49279 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SLC11A1P49279 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SLC11A1P49279 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SLC11A1P49279 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SLC11A1P49279 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SLC11A1P49279 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
SLC11A1P49279 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SLC11A1P49279 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SLC11A1P49279 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SLC11A1P49279 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SLC11A1P49279 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SLC11A1P49279 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SLC11A1P49279 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SLC11A1P49279 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SLC11A1P49279 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SLC11A1P49279 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SLC11A1P49279 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SLC11A1P49279 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SLC11A1P49279 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SLC11A1P49279 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SLC11A1P49279 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SLC11A1P49279 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SLC11A1P49279 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SLC11A1P49279 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SLC11A1P49279 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SLC11A1P49279 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SLC11A1P49279 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SLC11A1P49279 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SLC11A1P49279 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SLC11A1P49279 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SLC11A1P49279 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SLC11A1P49279 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SLC11A1P49279 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SLC11A1P49279 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SLC11A1P49279 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SLC11A1P49279 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SLC11A1P49279 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SLC11A1P49279 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SLC11A1P49279 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SLC11A1P49279 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SLC11A1P49279 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SLC11A1P49279 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SLC11A1P49279 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SLC11A1P49279 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SLC11A1P49279 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SLC11A1P49279 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
SLC11A1P49279 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SLC11A1P49279 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SLC11A1P49279 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms