Protein–RNA interactions for Protein: P43121

MCAM, Cell surface glycoprotein MUC18, humanhuman

Predictions only

Length 646 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCAMP43121 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
MCAMP43121 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
MCAMP43121 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
MCAMP43121 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
MCAMP43121 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
MCAMP43121 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
MCAMP43121 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
MCAMP43121 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
MCAMP43121 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
MCAMP43121 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
MCAMP43121 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
MCAMP43121 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
MCAMP43121 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
MCAMP43121 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
MCAMP43121 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
MCAMP43121 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
MCAMP43121 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
MCAMP43121 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
MCAMP43121 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
MCAMP43121 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
MCAMP43121 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
MCAMP43121 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
MCAMP43121 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
MCAMP43121 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC24.61■■□□□ 1.53
MCAMP43121 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
MCAMP43121 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
MCAMP43121 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
MCAMP43121 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
MCAMP43121 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
MCAMP43121 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
MCAMP43121 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
MCAMP43121 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
MCAMP43121 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
MCAMP43121 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
MCAMP43121 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
MCAMP43121 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
MCAMP43121 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
MCAMP43121 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
MCAMP43121 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.6■■□□□ 1.53
MCAMP43121 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
MCAMP43121 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
MCAMP43121 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
MCAMP43121 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
MCAMP43121 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
MCAMP43121 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
MCAMP43121 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
MCAMP43121 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
MCAMP43121 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
MCAMP43121 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
MCAMP43121 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
MCAMP43121 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
MCAMP43121 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
MCAMP43121 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
MCAMP43121 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
MCAMP43121 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC24.59■■□□□ 1.53
MCAMP43121 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
MCAMP43121 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
MCAMP43121 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
MCAMP43121 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
MCAMP43121 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
MCAMP43121 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
MCAMP43121 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
MCAMP43121 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
MCAMP43121 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
MCAMP43121 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
MCAMP43121 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
MCAMP43121 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
MCAMP43121 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
MCAMP43121 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
MCAMP43121 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
MCAMP43121 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
MCAMP43121 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
MCAMP43121 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
MCAMP43121 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
MCAMP43121 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
MCAMP43121 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
MCAMP43121 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
MCAMP43121 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
MCAMP43121 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
MCAMP43121 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
MCAMP43121 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
MCAMP43121 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
MCAMP43121 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
MCAMP43121 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
MCAMP43121 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
MCAMP43121 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
MCAMP43121 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
MCAMP43121 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
MCAMP43121 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
MCAMP43121 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
MCAMP43121 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
MCAMP43121 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
MCAMP43121 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
MCAMP43121 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
MCAMP43121 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
MCAMP43121 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
MCAMP43121 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
MCAMP43121 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
MCAMP43121 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
MCAMP43121 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms