Protein–RNA interactions for Protein: P37275

ZEB1, Zinc finger E-box-binding homeobox 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,124 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZEB1P37275 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
ZEB1P37275 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
ZEB1P37275 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
ZEB1P37275 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
ZEB1P37275 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC30■■■□□ 2.39
ZEB1P37275 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
ZEB1P37275 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
ZEB1P37275 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
ZEB1P37275 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
ZEB1P37275 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
ZEB1P37275 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
ZEB1P37275 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
ZEB1P37275 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
ZEB1P37275 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
ZEB1P37275 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
ZEB1P37275 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
ZEB1P37275 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
ZEB1P37275 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
ZEB1P37275 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
ZEB1P37275 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
ZEB1P37275 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
ZEB1P37275 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
ZEB1P37275 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
ZEB1P37275 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
ZEB1P37275 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
ZEB1P37275 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
ZEB1P37275 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
ZEB1P37275 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
ZEB1P37275 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
ZEB1P37275 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
ZEB1P37275 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
ZEB1P37275 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
ZEB1P37275 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC29.97■■■□□ 2.39
ZEB1P37275 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
ZEB1P37275 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
ZEB1P37275 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
ZEB1P37275 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
ZEB1P37275 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
ZEB1P37275 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
ZEB1P37275 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
ZEB1P37275 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
ZEB1P37275 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
ZEB1P37275 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
ZEB1P37275 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
ZEB1P37275 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
ZEB1P37275 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
ZEB1P37275 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
ZEB1P37275 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
ZEB1P37275 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
ZEB1P37275 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
ZEB1P37275 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
ZEB1P37275 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
ZEB1P37275 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
ZEB1P37275 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
ZEB1P37275 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
ZEB1P37275 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
ZEB1P37275 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
ZEB1P37275 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
ZEB1P37275 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
ZEB1P37275 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
ZEB1P37275 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
ZEB1P37275 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
ZEB1P37275 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC29.95■■■□□ 2.39
ZEB1P37275 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC29.95■■■□□ 2.39
ZEB1P37275 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
ZEB1P37275 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.39
ZEB1P37275 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.39
ZEB1P37275 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC29.95■■■□□ 2.39
ZEB1P37275 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
ZEB1P37275 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.38
ZEB1P37275 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
ZEB1P37275 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC29.95■■■□□ 2.38
ZEB1P37275 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC29.95■■■□□ 2.38
ZEB1P37275 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
ZEB1P37275 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
ZEB1P37275 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
ZEB1P37275 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
ZEB1P37275 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
ZEB1P37275 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
ZEB1P37275 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC29.94■■■□□ 2.38
ZEB1P37275 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC29.94■■■□□ 2.38
ZEB1P37275 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC29.94■■■□□ 2.38
ZEB1P37275 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
ZEB1P37275 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
ZEB1P37275 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
ZEB1P37275 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
ZEB1P37275 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
ZEB1P37275 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
ZEB1P37275 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
ZEB1P37275 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
ZEB1P37275 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
ZEB1P37275 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
ZEB1P37275 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
ZEB1P37275 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
ZEB1P37275 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
ZEB1P37275 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
ZEB1P37275 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
ZEB1P37275 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
ZEB1P37275 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
ZEB1P37275 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC29.93■■■□□ 2.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms