Protein–RNA interactions for Protein: P36578

RPL4, 60S ribosomal protein L4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL4P36578 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RPL4P36578 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RPL4P36578 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RPL4P36578 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RPL4P36578 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RPL4P36578 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RPL4P36578 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RPL4P36578 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RPL4P36578 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RPL4P36578 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RPL4P36578 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RPL4P36578 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RPL4P36578 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RPL4P36578 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RPL4P36578 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RPL4P36578 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RPL4P36578 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
RPL4P36578 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RPL4P36578 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RPL4P36578 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RPL4P36578 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RPL4P36578 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RPL4P36578 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RPL4P36578 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RPL4P36578 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RPL4P36578 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RPL4P36578 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RPL4P36578 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RPL4P36578 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RPL4P36578 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RPL4P36578 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RPL4P36578 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RPL4P36578 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RPL4P36578 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RPL4P36578 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RPL4P36578 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RPL4P36578 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RPL4P36578 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RPL4P36578 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RPL4P36578 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RPL4P36578 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RPL4P36578 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RPL4P36578 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RPL4P36578 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RPL4P36578 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RPL4P36578 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RPL4P36578 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RPL4P36578 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RPL4P36578 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RPL4P36578 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RPL4P36578 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RPL4P36578 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RPL4P36578 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RPL4P36578 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RPL4P36578 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RPL4P36578 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RPL4P36578 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RPL4P36578 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RPL4P36578 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RPL4P36578 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RPL4P36578 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
RPL4P36578 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RPL4P36578 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RPL4P36578 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RPL4P36578 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RPL4P36578 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RPL4P36578 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RPL4P36578 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RPL4P36578 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RPL4P36578 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RPL4P36578 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RPL4P36578 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RPL4P36578 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RPL4P36578 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RPL4P36578 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RPL4P36578 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RPL4P36578 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RPL4P36578 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RPL4P36578 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RPL4P36578 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RPL4P36578 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RPL4P36578 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
RPL4P36578 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RPL4P36578 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RPL4P36578 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RPL4P36578 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RPL4P36578 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
RPL4P36578 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RPL4P36578 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RPL4P36578 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RPL4P36578 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RPL4P36578 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
RPL4P36578 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RPL4P36578 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RPL4P36578 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RPL4P36578 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RPL4P36578 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RPL4P36578 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RPL4P36578 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RPL4P36578 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms