Protein–RNA interactions for Protein: P35606

COPB2, Coatomer subunit beta', humanhuman

Predictions only

Length 906 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPB2P35606 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
COPB2P35606 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
COPB2P35606 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
COPB2P35606 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
COPB2P35606 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
COPB2P35606 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
COPB2P35606 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
COPB2P35606 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
COPB2P35606 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
COPB2P35606 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
COPB2P35606 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
COPB2P35606 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
COPB2P35606 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
COPB2P35606 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
COPB2P35606 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
COPB2P35606 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
COPB2P35606 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC23.3■■□□□ 1.32
COPB2P35606 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
COPB2P35606 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
COPB2P35606 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
COPB2P35606 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
COPB2P35606 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
COPB2P35606 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
COPB2P35606 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
COPB2P35606 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
COPB2P35606 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
COPB2P35606 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
COPB2P35606 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
COPB2P35606 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
COPB2P35606 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
COPB2P35606 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
COPB2P35606 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
COPB2P35606 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
COPB2P35606 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
COPB2P35606 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
COPB2P35606 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
COPB2P35606 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
COPB2P35606 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
COPB2P35606 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
COPB2P35606 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
COPB2P35606 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
COPB2P35606 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
COPB2P35606 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
COPB2P35606 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
COPB2P35606 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
COPB2P35606 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
COPB2P35606 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
COPB2P35606 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
COPB2P35606 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
COPB2P35606 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
COPB2P35606 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
COPB2P35606 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
COPB2P35606 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
COPB2P35606 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
COPB2P35606 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
COPB2P35606 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
COPB2P35606 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
COPB2P35606 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
COPB2P35606 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
COPB2P35606 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
COPB2P35606 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
COPB2P35606 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
COPB2P35606 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
COPB2P35606 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
COPB2P35606 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
COPB2P35606 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
COPB2P35606 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
COPB2P35606 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
COPB2P35606 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
COPB2P35606 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
COPB2P35606 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
COPB2P35606 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
COPB2P35606 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
COPB2P35606 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
COPB2P35606 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
COPB2P35606 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
COPB2P35606 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
COPB2P35606 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
COPB2P35606 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
COPB2P35606 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
COPB2P35606 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
COPB2P35606 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
COPB2P35606 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
COPB2P35606 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
COPB2P35606 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
COPB2P35606 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
COPB2P35606 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
COPB2P35606 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
COPB2P35606 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
COPB2P35606 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
COPB2P35606 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
COPB2P35606 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
COPB2P35606 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
COPB2P35606 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
COPB2P35606 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
COPB2P35606 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
COPB2P35606 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
COPB2P35606 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
COPB2P35606 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
COPB2P35606 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.1 ms