Protein–RNA interactions for Protein: P35221

CTNNA1, Catenin alpha-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 906 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNA1P35221 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CTNNA1P35221 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CTNNA1P35221 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CTNNA1P35221 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CTNNA1P35221 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CTNNA1P35221 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CTNNA1P35221 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CTNNA1P35221 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CTNNA1P35221 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CTNNA1P35221 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CTNNA1P35221 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CTNNA1P35221 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CTNNA1P35221 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CTNNA1P35221 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CTNNA1P35221 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CTNNA1P35221 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CTNNA1P35221 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CTNNA1P35221 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CTNNA1P35221 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CTNNA1P35221 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CTNNA1P35221 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CTNNA1P35221 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CTNNA1P35221 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CTNNA1P35221 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
CTNNA1P35221 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CTNNA1P35221 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CTNNA1P35221 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CTNNA1P35221 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CTNNA1P35221 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CTNNA1P35221 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
CTNNA1P35221 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CTNNA1P35221 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CTNNA1P35221 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CTNNA1P35221 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CTNNA1P35221 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CTNNA1P35221 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CTNNA1P35221 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CTNNA1P35221 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CTNNA1P35221 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CTNNA1P35221 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CTNNA1P35221 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CTNNA1P35221 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CTNNA1P35221 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CTNNA1P35221 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CTNNA1P35221 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CTNNA1P35221 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CTNNA1P35221 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CTNNA1P35221 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CTNNA1P35221 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CTNNA1P35221 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CTNNA1P35221 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CTNNA1P35221 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CTNNA1P35221 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CTNNA1P35221 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CTNNA1P35221 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CTNNA1P35221 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CTNNA1P35221 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CTNNA1P35221 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CTNNA1P35221 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CTNNA1P35221 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CTNNA1P35221 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CTNNA1P35221 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CTNNA1P35221 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CTNNA1P35221 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CTNNA1P35221 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CTNNA1P35221 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CTNNA1P35221 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CTNNA1P35221 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CTNNA1P35221 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CTNNA1P35221 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CTNNA1P35221 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CTNNA1P35221 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CTNNA1P35221 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CTNNA1P35221 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CTNNA1P35221 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CTNNA1P35221 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CTNNA1P35221 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CTNNA1P35221 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CTNNA1P35221 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CTNNA1P35221 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CTNNA1P35221 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CTNNA1P35221 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CTNNA1P35221 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CTNNA1P35221 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CTNNA1P35221 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CTNNA1P35221 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CTNNA1P35221 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CTNNA1P35221 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CTNNA1P35221 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CTNNA1P35221 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CTNNA1P35221 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CTNNA1P35221 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CTNNA1P35221 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CTNNA1P35221 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CTNNA1P35221 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CTNNA1P35221 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CTNNA1P35221 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CTNNA1P35221 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CTNNA1P35221 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CTNNA1P35221 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.3 ms