Protein–RNA interactions for Protein: P33151

CDH5, Cadherin-5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 784 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH5P33151 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDH5P33151 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CDH5P33151 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CDH5P33151 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CDH5P33151 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CDH5P33151 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CDH5P33151 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CDH5P33151 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CDH5P33151 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CDH5P33151 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CDH5P33151 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CDH5P33151 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
CDH5P33151 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CDH5P33151 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CDH5P33151 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CDH5P33151 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CDH5P33151 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CDH5P33151 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CDH5P33151 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CDH5P33151 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CDH5P33151 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CDH5P33151 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CDH5P33151 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CDH5P33151 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CDH5P33151 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDH5P33151 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDH5P33151 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDH5P33151 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDH5P33151 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDH5P33151 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDH5P33151 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDH5P33151 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDH5P33151 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDH5P33151 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDH5P33151 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDH5P33151 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDH5P33151 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDH5P33151 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDH5P33151 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDH5P33151 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDH5P33151 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDH5P33151 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDH5P33151 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDH5P33151 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CDH5P33151 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CDH5P33151 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CDH5P33151 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CDH5P33151 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CDH5P33151 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CDH5P33151 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CDH5P33151 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CDH5P33151 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CDH5P33151 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CDH5P33151 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CDH5P33151 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CDH5P33151 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CDH5P33151 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CDH5P33151 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CDH5P33151 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CDH5P33151 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CDH5P33151 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CDH5P33151 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CDH5P33151 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CDH5P33151 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CDH5P33151 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CDH5P33151 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CDH5P33151 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CDH5P33151 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CDH5P33151 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CDH5P33151 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CDH5P33151 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CDH5P33151 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
CDH5P33151 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CDH5P33151 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CDH5P33151 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
CDH5P33151 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
CDH5P33151 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CDH5P33151 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CDH5P33151 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CDH5P33151 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
CDH5P33151 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CDH5P33151 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CDH5P33151 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CDH5P33151 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDH5P33151 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDH5P33151 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDH5P33151 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDH5P33151 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDH5P33151 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDH5P33151 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDH5P33151 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CDH5P33151 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDH5P33151 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDH5P33151 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDH5P33151 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDH5P33151 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDH5P33151 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDH5P33151 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CDH5P33151 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDH5P33151 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.5 ms