Protein–RNA interactions for Protein: P31415

CASQ1, Calsequestrin-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASQ1P31415 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
CASQ1P31415 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
CASQ1P31415 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CASQ1P31415 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CASQ1P31415 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CASQ1P31415 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CASQ1P31415 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CASQ1P31415 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CASQ1P31415 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CASQ1P31415 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CASQ1P31415 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CASQ1P31415 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CASQ1P31415 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
CASQ1P31415 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CASQ1P31415 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CASQ1P31415 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CASQ1P31415 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CASQ1P31415 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CASQ1P31415 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CASQ1P31415 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CASQ1P31415 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CASQ1P31415 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CASQ1P31415 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CASQ1P31415 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CASQ1P31415 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CASQ1P31415 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CASQ1P31415 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CASQ1P31415 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CASQ1P31415 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CASQ1P31415 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CASQ1P31415 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CASQ1P31415 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CASQ1P31415 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CASQ1P31415 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CASQ1P31415 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CASQ1P31415 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CASQ1P31415 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CASQ1P31415 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CASQ1P31415 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CASQ1P31415 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CASQ1P31415 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CASQ1P31415 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CASQ1P31415 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CASQ1P31415 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CASQ1P31415 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CASQ1P31415 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CASQ1P31415 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CASQ1P31415 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CASQ1P31415 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CASQ1P31415 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CASQ1P31415 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CASQ1P31415 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CASQ1P31415 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CASQ1P31415 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CASQ1P31415 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CASQ1P31415 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CASQ1P31415 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CASQ1P31415 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CASQ1P31415 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CASQ1P31415 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CASQ1P31415 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CASQ1P31415 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CASQ1P31415 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CASQ1P31415 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CASQ1P31415 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CASQ1P31415 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CASQ1P31415 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CASQ1P31415 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CASQ1P31415 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CASQ1P31415 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CASQ1P31415 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CASQ1P31415 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CASQ1P31415 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CASQ1P31415 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CASQ1P31415 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CASQ1P31415 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CASQ1P31415 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
CASQ1P31415 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CASQ1P31415 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
CASQ1P31415 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
CASQ1P31415 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CASQ1P31415 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CASQ1P31415 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CASQ1P31415 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CASQ1P31415 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CASQ1P31415 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CASQ1P31415 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CASQ1P31415 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CASQ1P31415 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CASQ1P31415 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CASQ1P31415 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CASQ1P31415 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CASQ1P31415 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CASQ1P31415 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CASQ1P31415 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CASQ1P31415 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CASQ1P31415 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CASQ1P31415 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CASQ1P31415 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CASQ1P31415 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
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